Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ14

Trpd52l3, Tumor protein D52-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpd52l3Q9CQ14 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpd52l3Q9CQ14 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpd52l3Q9CQ14 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpd52l3Q9CQ14 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpd52l3Q9CQ14 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpd52l3Q9CQ14 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpd52l3Q9CQ14 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpd52l3Q9CQ14 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpd52l3Q9CQ14 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpd52l3Q9CQ14 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpd52l3Q9CQ14 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpd52l3Q9CQ14 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpd52l3Q9CQ14 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpd52l3Q9CQ14 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpd52l3Q9CQ14 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpd52l3Q9CQ14 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpd52l3Q9CQ14 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpd52l3Q9CQ14 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpd52l3Q9CQ14 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpd52l3Q9CQ14 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpd52l3Q9CQ14 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpd52l3Q9CQ14 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpd52l3Q9CQ14 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpd52l3Q9CQ14 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpd52l3Q9CQ14 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpd52l3Q9CQ14 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpd52l3Q9CQ14 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpd52l3Q9CQ14 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpd52l3Q9CQ14 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpd52l3Q9CQ14 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpd52l3Q9CQ14 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpd52l3Q9CQ14 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpd52l3Q9CQ14 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpd52l3Q9CQ14 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpd52l3Q9CQ14 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpd52l3Q9CQ14 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpd52l3Q9CQ14 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpd52l3Q9CQ14 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpd52l3Q9CQ14 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpd52l3Q9CQ14 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpd52l3Q9CQ14 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpd52l3Q9CQ14 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpd52l3Q9CQ14 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpd52l3Q9CQ14 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpd52l3Q9CQ14 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpd52l3Q9CQ14 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpd52l3Q9CQ14 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpd52l3Q9CQ14 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpd52l3Q9CQ14 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpd52l3Q9CQ14 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpd52l3Q9CQ14 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpd52l3Q9CQ14 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpd52l3Q9CQ14 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpd52l3Q9CQ14 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpd52l3Q9CQ14 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpd52l3Q9CQ14 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpd52l3Q9CQ14 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpd52l3Q9CQ14 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpd52l3Q9CQ14 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpd52l3Q9CQ14 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpd52l3Q9CQ14 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpd52l3Q9CQ14 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpd52l3Q9CQ14 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpd52l3Q9CQ14 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpd52l3Q9CQ14 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpd52l3Q9CQ14 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpd52l3Q9CQ14 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpd52l3Q9CQ14 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpd52l3Q9CQ14 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpd52l3Q9CQ14 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpd52l3Q9CQ14 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpd52l3Q9CQ14 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpd52l3Q9CQ14 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpd52l3Q9CQ14 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpd52l3Q9CQ14 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpd52l3Q9CQ14 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpd52l3Q9CQ14 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpd52l3Q9CQ14 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpd52l3Q9CQ14 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpd52l3Q9CQ14 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpd52l3Q9CQ14 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpd52l3Q9CQ14 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpd52l3Q9CQ14 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpd52l3Q9CQ14 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpd52l3Q9CQ14 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpd52l3Q9CQ14 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpd52l3Q9CQ14 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpd52l3Q9CQ14 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpd52l3Q9CQ14 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpd52l3Q9CQ14 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpd52l3Q9CQ14 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpd52l3Q9CQ14 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpd52l3Q9CQ14 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpd52l3Q9CQ14 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trpd52l3Q9CQ14 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpd52l3Q9CQ14 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpd52l3Q9CQ14 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpd52l3Q9CQ14 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpd52l3Q9CQ14 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpd52l3Q9CQ14 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms