Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ska1Q9CPV1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ska1Q9CPV1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ska1Q9CPV1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ska1Q9CPV1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ska1Q9CPV1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ska1Q9CPV1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ska1Q9CPV1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ska1Q9CPV1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ska1Q9CPV1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ska1Q9CPV1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ska1Q9CPV1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ska1Q9CPV1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ska1Q9CPV1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ska1Q9CPV1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ska1Q9CPV1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ska1Q9CPV1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ska1Q9CPV1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ska1Q9CPV1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ska1Q9CPV1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ska1Q9CPV1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ska1Q9CPV1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ska1Q9CPV1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ska1Q9CPV1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ska1Q9CPV1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ska1Q9CPV1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ska1Q9CPV1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ska1Q9CPV1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ska1Q9CPV1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ska1Q9CPV1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ska1Q9CPV1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ska1Q9CPV1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ska1Q9CPV1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ska1Q9CPV1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ska1Q9CPV1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ska1Q9CPV1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ska1Q9CPV1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ska1Q9CPV1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ska1Q9CPV1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ska1Q9CPV1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ska1Q9CPV1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ska1Q9CPV1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ska1Q9CPV1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ska1Q9CPV1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ska1Q9CPV1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ska1Q9CPV1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ska1Q9CPV1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ska1Q9CPV1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ska1Q9CPV1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ska1Q9CPV1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ska1Q9CPV1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ska1Q9CPV1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ska1Q9CPV1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ska1Q9CPV1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ska1Q9CPV1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ska1Q9CPV1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ska1Q9CPV1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ska1Q9CPV1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ska1Q9CPV1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ska1Q9CPV1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ska1Q9CPV1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ska1Q9CPV1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ska1Q9CPV1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ska1Q9CPV1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ska1Q9CPV1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ska1Q9CPV1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ska1Q9CPV1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ska1Q9CPV1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ska1Q9CPV1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ska1Q9CPV1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ska1Q9CPV1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ska1Q9CPV1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ska1Q9CPV1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ska1Q9CPV1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ska1Q9CPV1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ska1Q9CPV1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ska1Q9CPV1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ska1Q9CPV1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ska1Q9CPV1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ska1Q9CPV1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ska1Q9CPV1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ska1Q9CPV1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ska1Q9CPV1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ska1Q9CPV1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ska1Q9CPV1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ska1Q9CPV1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ska1Q9CPV1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ska1Q9CPV1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ska1Q9CPV1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ska1Q9CPV1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ska1Q9CPV1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ska1Q9CPV1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ska1Q9CPV1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ska1Q9CPV1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ska1Q9CPV1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ska1Q9CPV1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ska1Q9CPV1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ska1Q9CPV1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ska1Q9CPV1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ska1Q9CPV1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 214.9 ms