Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bhlhe41Q99PV5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bhlhe41Q99PV5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Bhlhe41Q99PV5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bhlhe41Q99PV5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bhlhe41Q99PV5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bhlhe41Q99PV5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bhlhe41Q99PV5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bhlhe41Q99PV5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bhlhe41Q99PV5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bhlhe41Q99PV5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bhlhe41Q99PV5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bhlhe41Q99PV5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bhlhe41Q99PV5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bhlhe41Q99PV5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bhlhe41Q99PV5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bhlhe41Q99PV5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bhlhe41Q99PV5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bhlhe41Q99PV5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Bhlhe41Q99PV5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Bhlhe41Q99PV5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Bhlhe41Q99PV5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Bhlhe41Q99PV5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bhlhe41Q99PV5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bhlhe41Q99PV5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bhlhe41Q99PV5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bhlhe41Q99PV5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bhlhe41Q99PV5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bhlhe41Q99PV5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bhlhe41Q99PV5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bhlhe41Q99PV5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bhlhe41Q99PV5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bhlhe41Q99PV5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bhlhe41Q99PV5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bhlhe41Q99PV5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bhlhe41Q99PV5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bhlhe41Q99PV5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bhlhe41Q99PV5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bhlhe41Q99PV5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bhlhe41Q99PV5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bhlhe41Q99PV5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bhlhe41Q99PV5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bhlhe41Q99PV5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bhlhe41Q99PV5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bhlhe41Q99PV5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bhlhe41Q99PV5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Bhlhe41Q99PV5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Bhlhe41Q99PV5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Bhlhe41Q99PV5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bhlhe41Q99PV5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bhlhe41Q99PV5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bhlhe41Q99PV5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bhlhe41Q99PV5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bhlhe41Q99PV5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bhlhe41Q99PV5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bhlhe41Q99PV5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bhlhe41Q99PV5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Bhlhe41Q99PV5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bhlhe41Q99PV5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bhlhe41Q99PV5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bhlhe41Q99PV5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Bhlhe41Q99PV5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Bhlhe41Q99PV5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bhlhe41Q99PV5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bhlhe41Q99PV5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bhlhe41Q99PV5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bhlhe41Q99PV5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bhlhe41Q99PV5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bhlhe41Q99PV5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bhlhe41Q99PV5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bhlhe41Q99PV5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bhlhe41Q99PV5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bhlhe41Q99PV5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bhlhe41Q99PV5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bhlhe41Q99PV5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bhlhe41Q99PV5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bhlhe41Q99PV5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bhlhe41Q99PV5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Bhlhe41Q99PV5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bhlhe41Q99PV5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bhlhe41Q99PV5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bhlhe41Q99PV5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bhlhe41Q99PV5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bhlhe41Q99PV5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bhlhe41Q99PV5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bhlhe41Q99PV5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bhlhe41Q99PV5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bhlhe41Q99PV5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bhlhe41Q99PV5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bhlhe41Q99PV5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bhlhe41Q99PV5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bhlhe41Q99PV5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bhlhe41Q99PV5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bhlhe41Q99PV5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bhlhe41Q99PV5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bhlhe41Q99PV5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bhlhe41Q99PV5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bhlhe41Q99PV5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bhlhe41Q99PV5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bhlhe41Q99PV5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms