Protein–RNA interactions for Protein: Q99PF4

Cdh23, Cadherin-23, mousemouse

Predictions only

Length 3,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh23Q99PF4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdh23Q99PF4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdh23Q99PF4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdh23Q99PF4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdh23Q99PF4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdh23Q99PF4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdh23Q99PF4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdh23Q99PF4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdh23Q99PF4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdh23Q99PF4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdh23Q99PF4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdh23Q99PF4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdh23Q99PF4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdh23Q99PF4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdh23Q99PF4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdh23Q99PF4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdh23Q99PF4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdh23Q99PF4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdh23Q99PF4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdh23Q99PF4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdh23Q99PF4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdh23Q99PF4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdh23Q99PF4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdh23Q99PF4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdh23Q99PF4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdh23Q99PF4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdh23Q99PF4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdh23Q99PF4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdh23Q99PF4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdh23Q99PF4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdh23Q99PF4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdh23Q99PF4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdh23Q99PF4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdh23Q99PF4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdh23Q99PF4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdh23Q99PF4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdh23Q99PF4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdh23Q99PF4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdh23Q99PF4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdh23Q99PF4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdh23Q99PF4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdh23Q99PF4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdh23Q99PF4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdh23Q99PF4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdh23Q99PF4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdh23Q99PF4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdh23Q99PF4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdh23Q99PF4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdh23Q99PF4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdh23Q99PF4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdh23Q99PF4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdh23Q99PF4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdh23Q99PF4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdh23Q99PF4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdh23Q99PF4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdh23Q99PF4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdh23Q99PF4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdh23Q99PF4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdh23Q99PF4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdh23Q99PF4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdh23Q99PF4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdh23Q99PF4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdh23Q99PF4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cdh23Q99PF4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdh23Q99PF4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdh23Q99PF4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdh23Q99PF4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdh23Q99PF4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdh23Q99PF4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdh23Q99PF4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdh23Q99PF4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdh23Q99PF4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdh23Q99PF4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdh23Q99PF4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdh23Q99PF4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdh23Q99PF4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdh23Q99PF4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdh23Q99PF4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdh23Q99PF4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdh23Q99PF4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdh23Q99PF4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdh23Q99PF4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdh23Q99PF4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdh23Q99PF4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdh23Q99PF4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdh23Q99PF4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdh23Q99PF4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdh23Q99PF4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdh23Q99PF4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdh23Q99PF4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdh23Q99PF4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdh23Q99PF4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdh23Q99PF4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdh23Q99PF4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdh23Q99PF4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdh23Q99PF4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdh23Q99PF4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdh23Q99PF4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdh23Q99PF4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdh23Q99PF4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 190.1 ms