Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB3

Tcam1, Cell adhesion molecule TCAM-1, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcam1Q99NB3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcam1Q99NB3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcam1Q99NB3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcam1Q99NB3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcam1Q99NB3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcam1Q99NB3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcam1Q99NB3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcam1Q99NB3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tcam1Q99NB3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcam1Q99NB3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcam1Q99NB3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcam1Q99NB3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcam1Q99NB3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcam1Q99NB3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcam1Q99NB3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcam1Q99NB3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcam1Q99NB3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcam1Q99NB3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcam1Q99NB3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcam1Q99NB3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcam1Q99NB3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcam1Q99NB3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcam1Q99NB3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcam1Q99NB3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcam1Q99NB3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcam1Q99NB3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcam1Q99NB3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcam1Q99NB3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcam1Q99NB3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcam1Q99NB3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcam1Q99NB3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcam1Q99NB3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcam1Q99NB3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcam1Q99NB3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcam1Q99NB3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcam1Q99NB3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcam1Q99NB3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tcam1Q99NB3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tcam1Q99NB3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tcam1Q99NB3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcam1Q99NB3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcam1Q99NB3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcam1Q99NB3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcam1Q99NB3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcam1Q99NB3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcam1Q99NB3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcam1Q99NB3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcam1Q99NB3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcam1Q99NB3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcam1Q99NB3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcam1Q99NB3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcam1Q99NB3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcam1Q99NB3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcam1Q99NB3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcam1Q99NB3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcam1Q99NB3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcam1Q99NB3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcam1Q99NB3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcam1Q99NB3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcam1Q99NB3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcam1Q99NB3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcam1Q99NB3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcam1Q99NB3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcam1Q99NB3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcam1Q99NB3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcam1Q99NB3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcam1Q99NB3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcam1Q99NB3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcam1Q99NB3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcam1Q99NB3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcam1Q99NB3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcam1Q99NB3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcam1Q99NB3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcam1Q99NB3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcam1Q99NB3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcam1Q99NB3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcam1Q99NB3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcam1Q99NB3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcam1Q99NB3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcam1Q99NB3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcam1Q99NB3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcam1Q99NB3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcam1Q99NB3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcam1Q99NB3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcam1Q99NB3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcam1Q99NB3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcam1Q99NB3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcam1Q99NB3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcam1Q99NB3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcam1Q99NB3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcam1Q99NB3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcam1Q99NB3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcam1Q99NB3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcam1Q99NB3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcam1Q99NB3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcam1Q99NB3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcam1Q99NB3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcam1Q99NB3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcam1Q99NB3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcam1Q99NB3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms