Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ms4a4dQ99N05 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ms4a4dQ99N05 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ms4a4dQ99N05 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ms4a4dQ99N05 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ms4a4dQ99N05 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ms4a4dQ99N05 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ms4a4dQ99N05 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ms4a4dQ99N05 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ms4a4dQ99N05 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ms4a4dQ99N05 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ms4a4dQ99N05 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ms4a4dQ99N05 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ms4a4dQ99N05 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ms4a4dQ99N05 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ms4a4dQ99N05 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ms4a4dQ99N05 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ms4a4dQ99N05 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ms4a4dQ99N05 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ms4a4dQ99N05 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ms4a4dQ99N05 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ms4a4dQ99N05 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a4dQ99N05 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a4dQ99N05 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a4dQ99N05 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a4dQ99N05 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a4dQ99N05 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a4dQ99N05 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a4dQ99N05 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a4dQ99N05 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a4dQ99N05 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a4dQ99N05 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a4dQ99N05 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a4dQ99N05 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a4dQ99N05 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a4dQ99N05 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a4dQ99N05 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a4dQ99N05 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ms4a4dQ99N05 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ms4a4dQ99N05 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ms4a4dQ99N05 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ms4a4dQ99N05 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ms4a4dQ99N05 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a4dQ99N05 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a4dQ99N05 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a4dQ99N05 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a4dQ99N05 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a4dQ99N05 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a4dQ99N05 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a4dQ99N05 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a4dQ99N05 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a4dQ99N05 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a4dQ99N05 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a4dQ99N05 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a4dQ99N05 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a4dQ99N05 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a4dQ99N05 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a4dQ99N05 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a4dQ99N05 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a4dQ99N05 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a4dQ99N05 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a4dQ99N05 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a4dQ99N05 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a4dQ99N05 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a4dQ99N05 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a4dQ99N05 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a4dQ99N05 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a4dQ99N05 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a4dQ99N05 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a4dQ99N05 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a4dQ99N05 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a4dQ99N05 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a4dQ99N05 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a4dQ99N05 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a4dQ99N05 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ms4a4dQ99N05 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ms4a4dQ99N05 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a4dQ99N05 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a4dQ99N05 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a4dQ99N05 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a4dQ99N05 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ms4a4dQ99N05 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ms4a4dQ99N05 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ms4a4dQ99N05 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ms4a4dQ99N05 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ms4a4dQ99N05 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ms4a4dQ99N05 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ms4a4dQ99N05 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ms4a4dQ99N05 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ms4a4dQ99N05 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ms4a4dQ99N05 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ms4a4dQ99N05 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ms4a4dQ99N05 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ms4a4dQ99N05 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ms4a4dQ99N05 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ms4a4dQ99N05 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ms4a4dQ99N05 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ms4a4dQ99N05 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ms4a4dQ99N05 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ms4a4dQ99N05 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms