Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SncaipQ99ME3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SncaipQ99ME3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SncaipQ99ME3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SncaipQ99ME3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SncaipQ99ME3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SncaipQ99ME3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SncaipQ99ME3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SncaipQ99ME3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SncaipQ99ME3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SncaipQ99ME3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SncaipQ99ME3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SncaipQ99ME3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SncaipQ99ME3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SncaipQ99ME3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SncaipQ99ME3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SncaipQ99ME3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SncaipQ99ME3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SncaipQ99ME3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SncaipQ99ME3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SncaipQ99ME3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SncaipQ99ME3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SncaipQ99ME3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SncaipQ99ME3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SncaipQ99ME3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SncaipQ99ME3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SncaipQ99ME3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SncaipQ99ME3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SncaipQ99ME3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SncaipQ99ME3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SncaipQ99ME3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SncaipQ99ME3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SncaipQ99ME3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SncaipQ99ME3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SncaipQ99ME3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SncaipQ99ME3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SncaipQ99ME3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SncaipQ99ME3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SncaipQ99ME3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SncaipQ99ME3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SncaipQ99ME3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SncaipQ99ME3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SncaipQ99ME3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SncaipQ99ME3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SncaipQ99ME3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SncaipQ99ME3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SncaipQ99ME3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SncaipQ99ME3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SncaipQ99ME3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SncaipQ99ME3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SncaipQ99ME3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SncaipQ99ME3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SncaipQ99ME3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SncaipQ99ME3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SncaipQ99ME3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SncaipQ99ME3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SncaipQ99ME3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SncaipQ99ME3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SncaipQ99ME3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SncaipQ99ME3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SncaipQ99ME3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SncaipQ99ME3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SncaipQ99ME3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SncaipQ99ME3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SncaipQ99ME3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SncaipQ99ME3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SncaipQ99ME3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SncaipQ99ME3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SncaipQ99ME3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SncaipQ99ME3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SncaipQ99ME3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SncaipQ99ME3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SncaipQ99ME3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SncaipQ99ME3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SncaipQ99ME3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SncaipQ99ME3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SncaipQ99ME3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SncaipQ99ME3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SncaipQ99ME3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SncaipQ99ME3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SncaipQ99ME3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SncaipQ99ME3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SncaipQ99ME3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SncaipQ99ME3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SncaipQ99ME3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SncaipQ99ME3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SncaipQ99ME3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SncaipQ99ME3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SncaipQ99ME3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SncaipQ99ME3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SncaipQ99ME3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SncaipQ99ME3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SncaipQ99ME3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SncaipQ99ME3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SncaipQ99ME3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SncaipQ99ME3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SncaipQ99ME3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SncaipQ99ME3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SncaipQ99ME3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SncaipQ99ME3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms