Protein–RNA interactions for Protein: Q99M02

March2, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH2, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March2Q99M02 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
March2Q99M02 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
March2Q99M02 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
March2Q99M02 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
March2Q99M02 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
March2Q99M02 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
March2Q99M02 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
March2Q99M02 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
March2Q99M02 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
March2Q99M02 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
March2Q99M02 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
March2Q99M02 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
March2Q99M02 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
March2Q99M02 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
March2Q99M02 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
March2Q99M02 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
March2Q99M02 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
March2Q99M02 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
March2Q99M02 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
March2Q99M02 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
March2Q99M02 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
March2Q99M02 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
March2Q99M02 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
March2Q99M02 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
March2Q99M02 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
March2Q99M02 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
March2Q99M02 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
March2Q99M02 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
March2Q99M02 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
March2Q99M02 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
March2Q99M02 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
March2Q99M02 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
March2Q99M02 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
March2Q99M02 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
March2Q99M02 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
March2Q99M02 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
March2Q99M02 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
March2Q99M02 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
March2Q99M02 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
March2Q99M02 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
March2Q99M02 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
March2Q99M02 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
March2Q99M02 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
March2Q99M02 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
March2Q99M02 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
March2Q99M02 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
March2Q99M02 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
March2Q99M02 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
March2Q99M02 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
March2Q99M02 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
March2Q99M02 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
March2Q99M02 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
March2Q99M02 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
March2Q99M02 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
March2Q99M02 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
March2Q99M02 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
March2Q99M02 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
March2Q99M02 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
March2Q99M02 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
March2Q99M02 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
March2Q99M02 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
March2Q99M02 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
March2Q99M02 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
March2Q99M02 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
March2Q99M02 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
March2Q99M02 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
March2Q99M02 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
March2Q99M02 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
March2Q99M02 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
March2Q99M02 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
March2Q99M02 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
March2Q99M02 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
March2Q99M02 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
March2Q99M02 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
March2Q99M02 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
March2Q99M02 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
March2Q99M02 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
March2Q99M02 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
March2Q99M02 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
March2Q99M02 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
March2Q99M02 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
March2Q99M02 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
March2Q99M02 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
March2Q99M02 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
March2Q99M02 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
March2Q99M02 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
March2Q99M02 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
March2Q99M02 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
March2Q99M02 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
March2Q99M02 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
March2Q99M02 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
March2Q99M02 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
March2Q99M02 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
March2Q99M02 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
March2Q99M02 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
March2Q99M02 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
March2Q99M02 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
March2Q99M02 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
March2Q99M02 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
March2Q99M02 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms