Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ciao1Q99KN2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ciao1Q99KN2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ciao1Q99KN2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ciao1Q99KN2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ciao1Q99KN2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ciao1Q99KN2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ciao1Q99KN2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ciao1Q99KN2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ciao1Q99KN2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Ciao1Q99KN2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ciao1Q99KN2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ciao1Q99KN2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ciao1Q99KN2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ciao1Q99KN2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ciao1Q99KN2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ciao1Q99KN2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ciao1Q99KN2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ciao1Q99KN2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ciao1Q99KN2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ciao1Q99KN2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ciao1Q99KN2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ciao1Q99KN2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ciao1Q99KN2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ciao1Q99KN2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ciao1Q99KN2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ciao1Q99KN2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ciao1Q99KN2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ciao1Q99KN2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ciao1Q99KN2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ciao1Q99KN2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ciao1Q99KN2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ciao1Q99KN2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ciao1Q99KN2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ciao1Q99KN2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ciao1Q99KN2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ciao1Q99KN2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Ciao1Q99KN2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ciao1Q99KN2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ciao1Q99KN2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ciao1Q99KN2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ciao1Q99KN2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ciao1Q99KN2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ciao1Q99KN2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ciao1Q99KN2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ciao1Q99KN2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ciao1Q99KN2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ciao1Q99KN2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ciao1Q99KN2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Ciao1Q99KN2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ciao1Q99KN2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ciao1Q99KN2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ciao1Q99KN2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ciao1Q99KN2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ciao1Q99KN2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ciao1Q99KN2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ciao1Q99KN2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ciao1Q99KN2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Ciao1Q99KN2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ciao1Q99KN2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Ciao1Q99KN2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ciao1Q99KN2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ciao1Q99KN2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ciao1Q99KN2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ciao1Q99KN2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ciao1Q99KN2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ciao1Q99KN2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ciao1Q99KN2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ciao1Q99KN2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ciao1Q99KN2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ciao1Q99KN2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ciao1Q99KN2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ciao1Q99KN2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ciao1Q99KN2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ciao1Q99KN2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ciao1Q99KN2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ciao1Q99KN2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ciao1Q99KN2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ciao1Q99KN2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ciao1Q99KN2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ciao1Q99KN2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ciao1Q99KN2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ciao1Q99KN2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ciao1Q99KN2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ciao1Q99KN2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ciao1Q99KN2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ciao1Q99KN2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ciao1Q99KN2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ciao1Q99KN2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ciao1Q99KN2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ciao1Q99KN2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ciao1Q99KN2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ciao1Q99KN2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ciao1Q99KN2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ciao1Q99KN2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ciao1Q99KN2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ciao1Q99KN2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ciao1Q99KN2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ciao1Q99KN2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ciao1Q99KN2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms