Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dok4Q99KE3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dok4Q99KE3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dok4Q99KE3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Dok4Q99KE3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dok4Q99KE3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dok4Q99KE3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dok4Q99KE3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dok4Q99KE3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Dok4Q99KE3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dok4Q99KE3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dok4Q99KE3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dok4Q99KE3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dok4Q99KE3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dok4Q99KE3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dok4Q99KE3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dok4Q99KE3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dok4Q99KE3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dok4Q99KE3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dok4Q99KE3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dok4Q99KE3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Dok4Q99KE3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dok4Q99KE3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dok4Q99KE3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Dok4Q99KE3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dok4Q99KE3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dok4Q99KE3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dok4Q99KE3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Dok4Q99KE3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dok4Q99KE3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dok4Q99KE3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dok4Q99KE3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dok4Q99KE3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Dok4Q99KE3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dok4Q99KE3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dok4Q99KE3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dok4Q99KE3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dok4Q99KE3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Dok4Q99KE3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dok4Q99KE3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dok4Q99KE3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dok4Q99KE3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dok4Q99KE3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dok4Q99KE3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dok4Q99KE3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dok4Q99KE3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dok4Q99KE3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dok4Q99KE3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dok4Q99KE3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dok4Q99KE3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dok4Q99KE3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dok4Q99KE3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dok4Q99KE3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dok4Q99KE3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dok4Q99KE3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dok4Q99KE3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dok4Q99KE3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Dok4Q99KE3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dok4Q99KE3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dok4Q99KE3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dok4Q99KE3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dok4Q99KE3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dok4Q99KE3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dok4Q99KE3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dok4Q99KE3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dok4Q99KE3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dok4Q99KE3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dok4Q99KE3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dok4Q99KE3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dok4Q99KE3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dok4Q99KE3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dok4Q99KE3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dok4Q99KE3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dok4Q99KE3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dok4Q99KE3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dok4Q99KE3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dok4Q99KE3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Dok4Q99KE3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dok4Q99KE3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Dok4Q99KE3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dok4Q99KE3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dok4Q99KE3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dok4Q99KE3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dok4Q99KE3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Dok4Q99KE3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dok4Q99KE3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dok4Q99KE3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dok4Q99KE3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Dok4Q99KE3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Dok4Q99KE3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dok4Q99KE3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dok4Q99KE3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Dok4Q99KE3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dok4Q99KE3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dok4Q99KE3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dok4Q99KE3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dok4Q99KE3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dok4Q99KE3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dok4Q99KE3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dok4Q99KE3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms