Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC8

Vwa5a, von Willebrand factor A domain-containing protein 5A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5aQ99KC8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vwa5aQ99KC8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vwa5aQ99KC8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vwa5aQ99KC8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vwa5aQ99KC8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vwa5aQ99KC8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vwa5aQ99KC8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vwa5aQ99KC8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vwa5aQ99KC8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vwa5aQ99KC8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vwa5aQ99KC8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vwa5aQ99KC8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vwa5aQ99KC8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vwa5aQ99KC8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vwa5aQ99KC8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vwa5aQ99KC8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vwa5aQ99KC8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vwa5aQ99KC8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vwa5aQ99KC8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vwa5aQ99KC8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vwa5aQ99KC8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vwa5aQ99KC8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vwa5aQ99KC8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vwa5aQ99KC8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vwa5aQ99KC8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vwa5aQ99KC8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vwa5aQ99KC8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Vwa5aQ99KC8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Vwa5aQ99KC8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vwa5aQ99KC8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vwa5aQ99KC8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vwa5aQ99KC8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vwa5aQ99KC8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vwa5aQ99KC8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vwa5aQ99KC8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vwa5aQ99KC8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vwa5aQ99KC8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vwa5aQ99KC8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vwa5aQ99KC8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vwa5aQ99KC8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Vwa5aQ99KC8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vwa5aQ99KC8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vwa5aQ99KC8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vwa5aQ99KC8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vwa5aQ99KC8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vwa5aQ99KC8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vwa5aQ99KC8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vwa5aQ99KC8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vwa5aQ99KC8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vwa5aQ99KC8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Vwa5aQ99KC8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vwa5aQ99KC8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Vwa5aQ99KC8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vwa5aQ99KC8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vwa5aQ99KC8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vwa5aQ99KC8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vwa5aQ99KC8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vwa5aQ99KC8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vwa5aQ99KC8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vwa5aQ99KC8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vwa5aQ99KC8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vwa5aQ99KC8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Vwa5aQ99KC8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vwa5aQ99KC8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vwa5aQ99KC8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vwa5aQ99KC8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vwa5aQ99KC8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vwa5aQ99KC8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vwa5aQ99KC8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vwa5aQ99KC8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vwa5aQ99KC8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vwa5aQ99KC8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vwa5aQ99KC8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Vwa5aQ99KC8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vwa5aQ99KC8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vwa5aQ99KC8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vwa5aQ99KC8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vwa5aQ99KC8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vwa5aQ99KC8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vwa5aQ99KC8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vwa5aQ99KC8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vwa5aQ99KC8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vwa5aQ99KC8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vwa5aQ99KC8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vwa5aQ99KC8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vwa5aQ99KC8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vwa5aQ99KC8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vwa5aQ99KC8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Vwa5aQ99KC8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vwa5aQ99KC8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vwa5aQ99KC8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vwa5aQ99KC8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vwa5aQ99KC8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vwa5aQ99KC8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vwa5aQ99KC8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vwa5aQ99KC8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vwa5aQ99KC8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vwa5aQ99KC8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vwa5aQ99KC8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vwa5aQ99KC8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms