Protein–RNA interactions for Protein: Q99JX1

Taf11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf11Q99JX1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf11Q99JX1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf11Q99JX1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf11Q99JX1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf11Q99JX1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf11Q99JX1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf11Q99JX1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf11Q99JX1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf11Q99JX1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf11Q99JX1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Taf11Q99JX1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Taf11Q99JX1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Taf11Q99JX1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Taf11Q99JX1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Taf11Q99JX1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Taf11Q99JX1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Taf11Q99JX1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf11Q99JX1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf11Q99JX1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf11Q99JX1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf11Q99JX1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf11Q99JX1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf11Q99JX1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf11Q99JX1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf11Q99JX1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf11Q99JX1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf11Q99JX1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf11Q99JX1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf11Q99JX1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf11Q99JX1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf11Q99JX1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf11Q99JX1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf11Q99JX1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf11Q99JX1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf11Q99JX1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf11Q99JX1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf11Q99JX1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf11Q99JX1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf11Q99JX1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf11Q99JX1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf11Q99JX1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf11Q99JX1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf11Q99JX1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf11Q99JX1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf11Q99JX1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf11Q99JX1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf11Q99JX1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf11Q99JX1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf11Q99JX1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Taf11Q99JX1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Taf11Q99JX1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Taf11Q99JX1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Taf11Q99JX1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Taf11Q99JX1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf11Q99JX1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf11Q99JX1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf11Q99JX1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf11Q99JX1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf11Q99JX1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf11Q99JX1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf11Q99JX1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf11Q99JX1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf11Q99JX1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf11Q99JX1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf11Q99JX1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf11Q99JX1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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Taf11Q99JX1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf11Q99JX1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf11Q99JX1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf11Q99JX1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf11Q99JX1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Taf11Q99JX1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Taf11Q99JX1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf11Q99JX1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf11Q99JX1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf11Q99JX1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf11Q99JX1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf11Q99JX1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf11Q99JX1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf11Q99JX1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf11Q99JX1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf11Q99JX1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf11Q99JX1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf11Q99JX1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf11Q99JX1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf11Q99JX1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf11Q99JX1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf11Q99JX1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf11Q99JX1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf11Q99JX1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf11Q99JX1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Taf11Q99JX1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Taf11Q99JX1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf11Q99JX1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf11Q99JX1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf11Q99JX1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf11Q99JX1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf11Q99JX1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf11Q99JX1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms