Protein–RNA interactions for Protein: Q924X6

Lrp8, Low-density lipoprotein receptor-related protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 996 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp8Q924X6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrp8Q924X6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrp8Q924X6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrp8Q924X6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrp8Q924X6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrp8Q924X6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrp8Q924X6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrp8Q924X6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrp8Q924X6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrp8Q924X6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrp8Q924X6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrp8Q924X6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrp8Q924X6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrp8Q924X6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrp8Q924X6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrp8Q924X6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrp8Q924X6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrp8Q924X6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrp8Q924X6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrp8Q924X6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrp8Q924X6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrp8Q924X6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrp8Q924X6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrp8Q924X6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrp8Q924X6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrp8Q924X6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrp8Q924X6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrp8Q924X6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrp8Q924X6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrp8Q924X6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrp8Q924X6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrp8Q924X6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrp8Q924X6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrp8Q924X6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrp8Q924X6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrp8Q924X6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrp8Q924X6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrp8Q924X6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrp8Q924X6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrp8Q924X6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrp8Q924X6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrp8Q924X6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrp8Q924X6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrp8Q924X6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrp8Q924X6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrp8Q924X6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrp8Q924X6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrp8Q924X6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrp8Q924X6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrp8Q924X6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrp8Q924X6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrp8Q924X6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrp8Q924X6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrp8Q924X6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrp8Q924X6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrp8Q924X6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrp8Q924X6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrp8Q924X6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrp8Q924X6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrp8Q924X6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrp8Q924X6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrp8Q924X6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrp8Q924X6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrp8Q924X6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrp8Q924X6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrp8Q924X6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrp8Q924X6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrp8Q924X6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lrp8Q924X6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lrp8Q924X6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrp8Q924X6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrp8Q924X6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrp8Q924X6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrp8Q924X6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrp8Q924X6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrp8Q924X6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrp8Q924X6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrp8Q924X6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrp8Q924X6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrp8Q924X6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrp8Q924X6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrp8Q924X6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrp8Q924X6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrp8Q924X6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrp8Q924X6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrp8Q924X6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrp8Q924X6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrp8Q924X6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrp8Q924X6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrp8Q924X6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrp8Q924X6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrp8Q924X6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrp8Q924X6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrp8Q924X6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrp8Q924X6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrp8Q924X6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrp8Q924X6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrp8Q924X6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrp8Q924X6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrp8Q924X6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms