Protein–RNA interactions for Protein: Q922L6

Nelfcd, Negative elongation factor D, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfcdQ922L6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NelfcdQ922L6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NelfcdQ922L6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NelfcdQ922L6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NelfcdQ922L6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NelfcdQ922L6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NelfcdQ922L6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NelfcdQ922L6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NelfcdQ922L6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NelfcdQ922L6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NelfcdQ922L6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NelfcdQ922L6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NelfcdQ922L6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NelfcdQ922L6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NelfcdQ922L6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NelfcdQ922L6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NelfcdQ922L6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NelfcdQ922L6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NelfcdQ922L6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NelfcdQ922L6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NelfcdQ922L6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NelfcdQ922L6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NelfcdQ922L6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NelfcdQ922L6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NelfcdQ922L6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NelfcdQ922L6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NelfcdQ922L6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NelfcdQ922L6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NelfcdQ922L6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NelfcdQ922L6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NelfcdQ922L6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NelfcdQ922L6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NelfcdQ922L6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NelfcdQ922L6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NelfcdQ922L6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NelfcdQ922L6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NelfcdQ922L6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NelfcdQ922L6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NelfcdQ922L6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NelfcdQ922L6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NelfcdQ922L6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NelfcdQ922L6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NelfcdQ922L6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NelfcdQ922L6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NelfcdQ922L6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NelfcdQ922L6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NelfcdQ922L6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NelfcdQ922L6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NelfcdQ922L6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NelfcdQ922L6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NelfcdQ922L6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NelfcdQ922L6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NelfcdQ922L6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NelfcdQ922L6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NelfcdQ922L6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NelfcdQ922L6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NelfcdQ922L6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NelfcdQ922L6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NelfcdQ922L6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NelfcdQ922L6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NelfcdQ922L6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NelfcdQ922L6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NelfcdQ922L6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NelfcdQ922L6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NelfcdQ922L6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NelfcdQ922L6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NelfcdQ922L6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NelfcdQ922L6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NelfcdQ922L6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NelfcdQ922L6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NelfcdQ922L6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NelfcdQ922L6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NelfcdQ922L6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NelfcdQ922L6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NelfcdQ922L6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NelfcdQ922L6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NelfcdQ922L6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NelfcdQ922L6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NelfcdQ922L6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NelfcdQ922L6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NelfcdQ922L6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NelfcdQ922L6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NelfcdQ922L6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NelfcdQ922L6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NelfcdQ922L6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NelfcdQ922L6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NelfcdQ922L6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NelfcdQ922L6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NelfcdQ922L6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NelfcdQ922L6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NelfcdQ922L6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
NelfcdQ922L6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NelfcdQ922L6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NelfcdQ922L6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NelfcdQ922L6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NelfcdQ922L6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NelfcdQ922L6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NelfcdQ922L6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NelfcdQ922L6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NelfcdQ922L6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms