Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Clip1Q922J3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Clip1Q922J3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Clip1Q922J3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Clip1Q922J3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Clip1Q922J3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Clip1Q922J3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Clip1Q922J3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Clip1Q922J3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Clip1Q922J3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Clip1Q922J3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Clip1Q922J3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Clip1Q922J3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Clip1Q922J3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Clip1Q922J3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Clip1Q922J3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Clip1Q922J3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Clip1Q922J3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Clip1Q922J3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Clip1Q922J3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Clip1Q922J3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
Clip1Q922J3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Clip1Q922J3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
Clip1Q922J3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Clip1Q922J3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Clip1Q922J3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Clip1Q922J3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Clip1Q922J3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Clip1Q922J3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Clip1Q922J3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Clip1Q922J3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Clip1Q922J3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Clip1Q922J3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Clip1Q922J3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Clip1Q922J3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Clip1Q922J3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Clip1Q922J3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Clip1Q922J3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Clip1Q922J3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Clip1Q922J3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Clip1Q922J3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Clip1Q922J3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Clip1Q922J3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Clip1Q922J3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Clip1Q922J3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Clip1Q922J3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Clip1Q922J3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
Clip1Q922J3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
Clip1Q922J3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Clip1Q922J3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Clip1Q922J3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Clip1Q922J3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Clip1Q922J3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Clip1Q922J3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Clip1Q922J3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Clip1Q922J3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Clip1Q922J3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Clip1Q922J3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Clip1Q922J3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Clip1Q922J3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Clip1Q922J3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Clip1Q922J3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Clip1Q922J3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Clip1Q922J3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Clip1Q922J3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Clip1Q922J3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Clip1Q922J3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Clip1Q922J3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Clip1Q922J3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Clip1Q922J3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Clip1Q922J3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Clip1Q922J3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
Clip1Q922J3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Clip1Q922J3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Clip1Q922J3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Clip1Q922J3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Clip1Q922J3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Clip1Q922J3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Clip1Q922J3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Clip1Q922J3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Clip1Q922J3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Clip1Q922J3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Clip1Q922J3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Clip1Q922J3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Clip1Q922J3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Clip1Q922J3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Clip1Q922J3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Clip1Q922J3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Clip1Q922J3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Clip1Q922J3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Clip1Q922J3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Clip1Q922J3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Clip1Q922J3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Clip1Q922J3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Clip1Q922J3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Clip1Q922J3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Clip1Q922J3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Clip1Q922J3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Clip1Q922J3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Clip1Q922J3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms