Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Odf3Q920N1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Odf3Q920N1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Odf3Q920N1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Odf3Q920N1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Odf3Q920N1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Odf3Q920N1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Odf3Q920N1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Odf3Q920N1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Odf3Q920N1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Odf3Q920N1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Odf3Q920N1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf3Q920N1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf3Q920N1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf3Q920N1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf3Q920N1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf3Q920N1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf3Q920N1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf3Q920N1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf3Q920N1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf3Q920N1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf3Q920N1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf3Q920N1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf3Q920N1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf3Q920N1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf3Q920N1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf3Q920N1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf3Q920N1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf3Q920N1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Odf3Q920N1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Odf3Q920N1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Odf3Q920N1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Odf3Q920N1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Odf3Q920N1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Odf3Q920N1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Odf3Q920N1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Odf3Q920N1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Odf3Q920N1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Odf3Q920N1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Odf3Q920N1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Odf3Q920N1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Odf3Q920N1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Odf3Q920N1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Odf3Q920N1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Odf3Q920N1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Odf3Q920N1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Odf3Q920N1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf3Q920N1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf3Q920N1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf3Q920N1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf3Q920N1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf3Q920N1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf3Q920N1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf3Q920N1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf3Q920N1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf3Q920N1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf3Q920N1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf3Q920N1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf3Q920N1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf3Q920N1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf3Q920N1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf3Q920N1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf3Q920N1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf3Q920N1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf3Q920N1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf3Q920N1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf3Q920N1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf3Q920N1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Odf3Q920N1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Odf3Q920N1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Odf3Q920N1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Odf3Q920N1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Odf3Q920N1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Odf3Q920N1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Odf3Q920N1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Odf3Q920N1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Odf3Q920N1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Odf3Q920N1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Odf3Q920N1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Odf3Q920N1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Odf3Q920N1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Odf3Q920N1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Odf3Q920N1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Odf3Q920N1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Odf3Q920N1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Odf3Q920N1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Odf3Q920N1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Odf3Q920N1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Odf3Q920N1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Odf3Q920N1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Odf3Q920N1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Odf3Q920N1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Odf3Q920N1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Odf3Q920N1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Odf3Q920N1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Odf3Q920N1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Odf3Q920N1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Odf3Q920N1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Odf3Q920N1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Odf3Q920N1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms