Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Afg3l1Q920A7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Afg3l1Q920A7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Afg3l1Q920A7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Afg3l1Q920A7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.4 ms