Protein–RNA interactions for Protein: Q91W82

Ube2e2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e2Q91W82 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2e2Q91W82 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2e2Q91W82 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2e2Q91W82 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2e2Q91W82 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2e2Q91W82 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2e2Q91W82 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2e2Q91W82 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2e2Q91W82 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2e2Q91W82 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2e2Q91W82 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ube2e2Q91W82 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2e2Q91W82 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2e2Q91W82 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2e2Q91W82 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2e2Q91W82 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2e2Q91W82 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2e2Q91W82 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2e2Q91W82 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2e2Q91W82 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2e2Q91W82 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2e2Q91W82 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2e2Q91W82 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2e2Q91W82 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2e2Q91W82 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2e2Q91W82 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2e2Q91W82 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2e2Q91W82 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2e2Q91W82 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2e2Q91W82 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2e2Q91W82 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2e2Q91W82 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2e2Q91W82 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2e2Q91W82 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2e2Q91W82 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2e2Q91W82 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2e2Q91W82 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2e2Q91W82 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2e2Q91W82 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2e2Q91W82 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2e2Q91W82 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2e2Q91W82 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2e2Q91W82 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2e2Q91W82 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2e2Q91W82 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2e2Q91W82 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2e2Q91W82 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2e2Q91W82 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2e2Q91W82 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2e2Q91W82 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2e2Q91W82 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2e2Q91W82 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2e2Q91W82 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2e2Q91W82 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2e2Q91W82 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2e2Q91W82 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2e2Q91W82 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2e2Q91W82 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2e2Q91W82 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2e2Q91W82 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2e2Q91W82 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2e2Q91W82 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2e2Q91W82 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2e2Q91W82 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2e2Q91W82 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2e2Q91W82 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2e2Q91W82 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2e2Q91W82 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2e2Q91W82 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2e2Q91W82 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2e2Q91W82 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2e2Q91W82 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2e2Q91W82 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2e2Q91W82 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2e2Q91W82 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2e2Q91W82 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2e2Q91W82 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2e2Q91W82 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2e2Q91W82 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2e2Q91W82 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2e2Q91W82 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2e2Q91W82 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2e2Q91W82 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2e2Q91W82 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2e2Q91W82 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2e2Q91W82 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2e2Q91W82 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2e2Q91W82 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2e2Q91W82 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2e2Q91W82 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2e2Q91W82 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2e2Q91W82 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2e2Q91W82 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2e2Q91W82 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2e2Q91W82 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2e2Q91W82 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2e2Q91W82 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2e2Q91W82 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2e2Q91W82 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2e2Q91W82 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms