Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usb1Q91W78 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usb1Q91W78 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usb1Q91W78 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usb1Q91W78 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usb1Q91W78 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usb1Q91W78 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usb1Q91W78 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usb1Q91W78 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usb1Q91W78 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usb1Q91W78 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usb1Q91W78 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usb1Q91W78 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usb1Q91W78 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Usb1Q91W78 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usb1Q91W78 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usb1Q91W78 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usb1Q91W78 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usb1Q91W78 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usb1Q91W78 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usb1Q91W78 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usb1Q91W78 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usb1Q91W78 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Usb1Q91W78 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usb1Q91W78 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usb1Q91W78 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usb1Q91W78 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Usb1Q91W78 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Usb1Q91W78 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usb1Q91W78 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usb1Q91W78 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usb1Q91W78 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usb1Q91W78 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usb1Q91W78 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usb1Q91W78 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usb1Q91W78 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usb1Q91W78 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usb1Q91W78 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usb1Q91W78 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usb1Q91W78 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usb1Q91W78 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Usb1Q91W78 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usb1Q91W78 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usb1Q91W78 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Usb1Q91W78 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usb1Q91W78 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usb1Q91W78 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usb1Q91W78 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usb1Q91W78 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usb1Q91W78 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usb1Q91W78 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usb1Q91W78 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usb1Q91W78 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usb1Q91W78 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usb1Q91W78 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usb1Q91W78 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usb1Q91W78 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usb1Q91W78 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Usb1Q91W78 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usb1Q91W78 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usb1Q91W78 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usb1Q91W78 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Usb1Q91W78 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Usb1Q91W78 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usb1Q91W78 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usb1Q91W78 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usb1Q91W78 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usb1Q91W78 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usb1Q91W78 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usb1Q91W78 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usb1Q91W78 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usb1Q91W78 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usb1Q91W78 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usb1Q91W78 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usb1Q91W78 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usb1Q91W78 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usb1Q91W78 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Usb1Q91W78 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usb1Q91W78 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usb1Q91W78 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usb1Q91W78 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usb1Q91W78 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usb1Q91W78 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usb1Q91W78 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usb1Q91W78 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usb1Q91W78 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usb1Q91W78 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usb1Q91W78 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usb1Q91W78 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usb1Q91W78 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usb1Q91W78 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usb1Q91W78 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usb1Q91W78 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Usb1Q91W78 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usb1Q91W78 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Usb1Q91W78 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usb1Q91W78 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usb1Q91W78 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usb1Q91W78 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usb1Q91W78 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102 ms