Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp3Q91W36 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp3Q91W36 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp3Q91W36 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp3Q91W36 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp3Q91W36 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp3Q91W36 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp3Q91W36 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp3Q91W36 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp3Q91W36 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp3Q91W36 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp3Q91W36 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp3Q91W36 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp3Q91W36 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp3Q91W36 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp3Q91W36 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp3Q91W36 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp3Q91W36 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp3Q91W36 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp3Q91W36 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp3Q91W36 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp3Q91W36 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp3Q91W36 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp3Q91W36 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp3Q91W36 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp3Q91W36 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp3Q91W36 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp3Q91W36 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp3Q91W36 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp3Q91W36 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp3Q91W36 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Usp3Q91W36 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp3Q91W36 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp3Q91W36 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp3Q91W36 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp3Q91W36 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp3Q91W36 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp3Q91W36 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp3Q91W36 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp3Q91W36 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp3Q91W36 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp3Q91W36 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp3Q91W36 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp3Q91W36 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp3Q91W36 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp3Q91W36 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp3Q91W36 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp3Q91W36 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp3Q91W36 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp3Q91W36 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp3Q91W36 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp3Q91W36 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp3Q91W36 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp3Q91W36 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp3Q91W36 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp3Q91W36 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp3Q91W36 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp3Q91W36 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp3Q91W36 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp3Q91W36 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp3Q91W36 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp3Q91W36 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp3Q91W36 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp3Q91W36 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp3Q91W36 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp3Q91W36 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp3Q91W36 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp3Q91W36 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp3Q91W36 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp3Q91W36 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp3Q91W36 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp3Q91W36 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp3Q91W36 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Usp3Q91W36 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp3Q91W36 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp3Q91W36 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp3Q91W36 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp3Q91W36 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp3Q91W36 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp3Q91W36 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp3Q91W36 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp3Q91W36 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp3Q91W36 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp3Q91W36 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp3Q91W36 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp3Q91W36 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp3Q91W36 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp3Q91W36 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp3Q91W36 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp3Q91W36 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp3Q91W36 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp3Q91W36 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp3Q91W36 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp3Q91W36 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp3Q91W36 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp3Q91W36 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp3Q91W36 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp3Q91W36 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp3Q91W36 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp3Q91W36 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms