Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capn8Q91VA3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Capn8Q91VA3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Capn8Q91VA3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capn8Q91VA3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capn8Q91VA3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capn8Q91VA3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Capn8Q91VA3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Capn8Q91VA3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capn8Q91VA3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capn8Q91VA3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capn8Q91VA3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capn8Q91VA3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capn8Q91VA3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capn8Q91VA3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capn8Q91VA3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capn8Q91VA3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capn8Q91VA3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capn8Q91VA3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capn8Q91VA3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capn8Q91VA3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Capn8Q91VA3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capn8Q91VA3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Capn8Q91VA3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Capn8Q91VA3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Capn8Q91VA3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Capn8Q91VA3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Capn8Q91VA3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn8Q91VA3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn8Q91VA3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn8Q91VA3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn8Q91VA3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn8Q91VA3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn8Q91VA3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn8Q91VA3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn8Q91VA3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Capn8Q91VA3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Capn8Q91VA3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Capn8Q91VA3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn8Q91VA3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn8Q91VA3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn8Q91VA3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn8Q91VA3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn8Q91VA3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn8Q91VA3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn8Q91VA3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn8Q91VA3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn8Q91VA3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn8Q91VA3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Capn8Q91VA3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Capn8Q91VA3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Capn8Q91VA3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Capn8Q91VA3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Capn8Q91VA3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Capn8Q91VA3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Capn8Q91VA3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn8Q91VA3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn8Q91VA3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn8Q91VA3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn8Q91VA3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn8Q91VA3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn8Q91VA3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn8Q91VA3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn8Q91VA3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn8Q91VA3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Capn8Q91VA3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Capn8Q91VA3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Capn8Q91VA3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn8Q91VA3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn8Q91VA3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn8Q91VA3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn8Q91VA3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn8Q91VA3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn8Q91VA3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn8Q91VA3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn8Q91VA3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn8Q91VA3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn8Q91VA3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn8Q91VA3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Capn8Q91VA3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Capn8Q91VA3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Capn8Q91VA3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Capn8Q91VA3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Capn8Q91VA3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Capn8Q91VA3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Capn8Q91VA3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Capn8Q91VA3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Capn8Q91VA3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Capn8Q91VA3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Capn8Q91VA3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Capn8Q91VA3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Capn8Q91VA3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Capn8Q91VA3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Capn8Q91VA3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Capn8Q91VA3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capn8Q91VA3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capn8Q91VA3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Capn8Q91VA3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capn8Q91VA3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Capn8Q91VA3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms