Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SelenomQ8VHC3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SelenomQ8VHC3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SelenomQ8VHC3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SelenomQ8VHC3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SelenomQ8VHC3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SelenomQ8VHC3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SelenomQ8VHC3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SelenomQ8VHC3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SelenomQ8VHC3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SelenomQ8VHC3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SelenomQ8VHC3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SelenomQ8VHC3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SelenomQ8VHC3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SelenomQ8VHC3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SelenomQ8VHC3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SelenomQ8VHC3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SelenomQ8VHC3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SelenomQ8VHC3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SelenomQ8VHC3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SelenomQ8VHC3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SelenomQ8VHC3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SelenomQ8VHC3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SelenomQ8VHC3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SelenomQ8VHC3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SelenomQ8VHC3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SelenomQ8VHC3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SelenomQ8VHC3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SelenomQ8VHC3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SelenomQ8VHC3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SelenomQ8VHC3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SelenomQ8VHC3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SelenomQ8VHC3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SelenomQ8VHC3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SelenomQ8VHC3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SelenomQ8VHC3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SelenomQ8VHC3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SelenomQ8VHC3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SelenomQ8VHC3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SelenomQ8VHC3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SelenomQ8VHC3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SelenomQ8VHC3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SelenomQ8VHC3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SelenomQ8VHC3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SelenomQ8VHC3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SelenomQ8VHC3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SelenomQ8VHC3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SelenomQ8VHC3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SelenomQ8VHC3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SelenomQ8VHC3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SelenomQ8VHC3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SelenomQ8VHC3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SelenomQ8VHC3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SelenomQ8VHC3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SelenomQ8VHC3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SelenomQ8VHC3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SelenomQ8VHC3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SelenomQ8VHC3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SelenomQ8VHC3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SelenomQ8VHC3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SelenomQ8VHC3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SelenomQ8VHC3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SelenomQ8VHC3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SelenomQ8VHC3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SelenomQ8VHC3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SelenomQ8VHC3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SelenomQ8VHC3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SelenomQ8VHC3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SelenomQ8VHC3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SelenomQ8VHC3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SelenomQ8VHC3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SelenomQ8VHC3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SelenomQ8VHC3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SelenomQ8VHC3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SelenomQ8VHC3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SelenomQ8VHC3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SelenomQ8VHC3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SelenomQ8VHC3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SelenomQ8VHC3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SelenomQ8VHC3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SelenomQ8VHC3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SelenomQ8VHC3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SelenomQ8VHC3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SelenomQ8VHC3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SelenomQ8VHC3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SelenomQ8VHC3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SelenomQ8VHC3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SelenomQ8VHC3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SelenomQ8VHC3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SelenomQ8VHC3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SelenomQ8VHC3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SelenomQ8VHC3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SelenomQ8VHC3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SelenomQ8VHC3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SelenomQ8VHC3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SelenomQ8VHC3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SelenomQ8VHC3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SelenomQ8VHC3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SelenomQ8VHC3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SelenomQ8VHC3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.8 ms