Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG4

Exd2, Exonuclease 3'-5' domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exd2Q8VEG4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Exd2Q8VEG4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Exd2Q8VEG4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Exd2Q8VEG4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Exd2Q8VEG4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Exd2Q8VEG4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Exd2Q8VEG4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Exd2Q8VEG4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Exd2Q8VEG4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Exd2Q8VEG4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Exd2Q8VEG4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Exd2Q8VEG4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Exd2Q8VEG4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Exd2Q8VEG4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Exd2Q8VEG4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Exd2Q8VEG4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Exd2Q8VEG4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Exd2Q8VEG4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Exd2Q8VEG4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Exd2Q8VEG4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Exd2Q8VEG4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Exd2Q8VEG4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Exd2Q8VEG4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Exd2Q8VEG4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Exd2Q8VEG4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Exd2Q8VEG4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Exd2Q8VEG4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Exd2Q8VEG4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Exd2Q8VEG4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Exd2Q8VEG4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Exd2Q8VEG4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Exd2Q8VEG4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Exd2Q8VEG4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Exd2Q8VEG4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Exd2Q8VEG4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Exd2Q8VEG4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Exd2Q8VEG4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Exd2Q8VEG4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Exd2Q8VEG4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Exd2Q8VEG4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Exd2Q8VEG4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Exd2Q8VEG4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Exd2Q8VEG4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Exd2Q8VEG4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Exd2Q8VEG4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Exd2Q8VEG4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Exd2Q8VEG4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Exd2Q8VEG4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Exd2Q8VEG4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Exd2Q8VEG4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Exd2Q8VEG4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Exd2Q8VEG4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Exd2Q8VEG4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Exd2Q8VEG4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Exd2Q8VEG4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Exd2Q8VEG4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Exd2Q8VEG4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Exd2Q8VEG4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Exd2Q8VEG4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Exd2Q8VEG4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Exd2Q8VEG4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Exd2Q8VEG4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Exd2Q8VEG4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Exd2Q8VEG4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Exd2Q8VEG4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Exd2Q8VEG4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Exd2Q8VEG4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Exd2Q8VEG4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Exd2Q8VEG4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Exd2Q8VEG4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Exd2Q8VEG4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Exd2Q8VEG4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Exd2Q8VEG4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Exd2Q8VEG4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Exd2Q8VEG4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Exd2Q8VEG4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Exd2Q8VEG4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Exd2Q8VEG4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Exd2Q8VEG4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Exd2Q8VEG4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Exd2Q8VEG4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Exd2Q8VEG4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Exd2Q8VEG4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Exd2Q8VEG4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Exd2Q8VEG4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Exd2Q8VEG4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Exd2Q8VEG4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Exd2Q8VEG4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Exd2Q8VEG4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Exd2Q8VEG4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Exd2Q8VEG4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Exd2Q8VEG4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Exd2Q8VEG4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Exd2Q8VEG4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Exd2Q8VEG4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Exd2Q8VEG4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Exd2Q8VEG4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Exd2Q8VEG4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Exd2Q8VEG4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Exd2Q8VEG4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms