Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU3

Apol9a, Apol9a protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9aQ8VDU3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Apol9aQ8VDU3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Apol9aQ8VDU3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Apol9aQ8VDU3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Apol9aQ8VDU3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Apol9aQ8VDU3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Apol9aQ8VDU3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Apol9aQ8VDU3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Apol9aQ8VDU3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Apol9aQ8VDU3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Apol9aQ8VDU3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Apol9aQ8VDU3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Apol9aQ8VDU3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Apol9aQ8VDU3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apol9aQ8VDU3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apol9aQ8VDU3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apol9aQ8VDU3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apol9aQ8VDU3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apol9aQ8VDU3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apol9aQ8VDU3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apol9aQ8VDU3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apol9aQ8VDU3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apol9aQ8VDU3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apol9aQ8VDU3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apol9aQ8VDU3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apol9aQ8VDU3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apol9aQ8VDU3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Apol9aQ8VDU3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Apol9aQ8VDU3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Apol9aQ8VDU3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Apol9aQ8VDU3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apol9aQ8VDU3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apol9aQ8VDU3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apol9aQ8VDU3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Apol9aQ8VDU3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apol9aQ8VDU3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apol9aQ8VDU3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Apol9aQ8VDU3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Apol9aQ8VDU3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Apol9aQ8VDU3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apol9aQ8VDU3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apol9aQ8VDU3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apol9aQ8VDU3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apol9aQ8VDU3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apol9aQ8VDU3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apol9aQ8VDU3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apol9aQ8VDU3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apol9aQ8VDU3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apol9aQ8VDU3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apol9aQ8VDU3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Apol9aQ8VDU3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apol9aQ8VDU3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apol9aQ8VDU3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apol9aQ8VDU3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apol9aQ8VDU3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apol9aQ8VDU3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apol9aQ8VDU3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apol9aQ8VDU3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apol9aQ8VDU3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Apol9aQ8VDU3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Apol9aQ8VDU3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apol9aQ8VDU3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apol9aQ8VDU3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Apol9aQ8VDU3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apol9aQ8VDU3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apol9aQ8VDU3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apol9aQ8VDU3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apol9aQ8VDU3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apol9aQ8VDU3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apol9aQ8VDU3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apol9aQ8VDU3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apol9aQ8VDU3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apol9aQ8VDU3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apol9aQ8VDU3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apol9aQ8VDU3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apol9aQ8VDU3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apol9aQ8VDU3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apol9aQ8VDU3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apol9aQ8VDU3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apol9aQ8VDU3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apol9aQ8VDU3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apol9aQ8VDU3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apol9aQ8VDU3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apol9aQ8VDU3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apol9aQ8VDU3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apol9aQ8VDU3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apol9aQ8VDU3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apol9aQ8VDU3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apol9aQ8VDU3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apol9aQ8VDU3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apol9aQ8VDU3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apol9aQ8VDU3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apol9aQ8VDU3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apol9aQ8VDU3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apol9aQ8VDU3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apol9aQ8VDU3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apol9aQ8VDU3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apol9aQ8VDU3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apol9aQ8VDU3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apol9aQ8VDU3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms