Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC33

Nxnl1, Nucleoredoxin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxnl1Q8VC33 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Nxnl1Q8VC33 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nxnl1Q8VC33 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nxnl1Q8VC33 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nxnl1Q8VC33 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nxnl1Q8VC33 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nxnl1Q8VC33 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nxnl1Q8VC33 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nxnl1Q8VC33 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nxnl1Q8VC33 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nxnl1Q8VC33 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nxnl1Q8VC33 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nxnl1Q8VC33 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nxnl1Q8VC33 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nxnl1Q8VC33 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nxnl1Q8VC33 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nxnl1Q8VC33 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nxnl1Q8VC33 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nxnl1Q8VC33 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nxnl1Q8VC33 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Nxnl1Q8VC33 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nxnl1Q8VC33 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nxnl1Q8VC33 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nxnl1Q8VC33 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nxnl1Q8VC33 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nxnl1Q8VC33 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nxnl1Q8VC33 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nxnl1Q8VC33 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nxnl1Q8VC33 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nxnl1Q8VC33 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nxnl1Q8VC33 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nxnl1Q8VC33 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nxnl1Q8VC33 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nxnl1Q8VC33 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nxnl1Q8VC33 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nxnl1Q8VC33 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nxnl1Q8VC33 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nxnl1Q8VC33 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nxnl1Q8VC33 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nxnl1Q8VC33 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nxnl1Q8VC33 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Nxnl1Q8VC33 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nxnl1Q8VC33 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nxnl1Q8VC33 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nxnl1Q8VC33 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nxnl1Q8VC33 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Nxnl1Q8VC33 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nxnl1Q8VC33 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nxnl1Q8VC33 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nxnl1Q8VC33 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nxnl1Q8VC33 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nxnl1Q8VC33 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nxnl1Q8VC33 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nxnl1Q8VC33 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nxnl1Q8VC33 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nxnl1Q8VC33 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nxnl1Q8VC33 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nxnl1Q8VC33 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nxnl1Q8VC33 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nxnl1Q8VC33 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nxnl1Q8VC33 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nxnl1Q8VC33 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nxnl1Q8VC33 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nxnl1Q8VC33 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nxnl1Q8VC33 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nxnl1Q8VC33 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nxnl1Q8VC33 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nxnl1Q8VC33 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nxnl1Q8VC33 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nxnl1Q8VC33 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nxnl1Q8VC33 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nxnl1Q8VC33 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nxnl1Q8VC33 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nxnl1Q8VC33 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nxnl1Q8VC33 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nxnl1Q8VC33 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nxnl1Q8VC33 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nxnl1Q8VC33 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Nxnl1Q8VC33 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nxnl1Q8VC33 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nxnl1Q8VC33 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nxnl1Q8VC33 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nxnl1Q8VC33 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nxnl1Q8VC33 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Nxnl1Q8VC33 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nxnl1Q8VC33 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nxnl1Q8VC33 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Nxnl1Q8VC33 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nxnl1Q8VC33 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nxnl1Q8VC33 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nxnl1Q8VC33 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nxnl1Q8VC33 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Nxnl1Q8VC33 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nxnl1Q8VC33 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nxnl1Q8VC33 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nxnl1Q8VC33 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Nxnl1Q8VC33 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nxnl1Q8VC33 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nxnl1Q8VC33 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nxnl1Q8VC33 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms