Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBV7

Cops8, COP9 signalosome complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops8Q8VBV7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cops8Q8VBV7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cops8Q8VBV7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cops8Q8VBV7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cops8Q8VBV7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cops8Q8VBV7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cops8Q8VBV7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cops8Q8VBV7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cops8Q8VBV7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cops8Q8VBV7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cops8Q8VBV7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cops8Q8VBV7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cops8Q8VBV7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cops8Q8VBV7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cops8Q8VBV7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cops8Q8VBV7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cops8Q8VBV7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cops8Q8VBV7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cops8Q8VBV7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cops8Q8VBV7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cops8Q8VBV7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cops8Q8VBV7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cops8Q8VBV7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cops8Q8VBV7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cops8Q8VBV7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cops8Q8VBV7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cops8Q8VBV7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cops8Q8VBV7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cops8Q8VBV7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cops8Q8VBV7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cops8Q8VBV7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cops8Q8VBV7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cops8Q8VBV7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cops8Q8VBV7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cops8Q8VBV7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cops8Q8VBV7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cops8Q8VBV7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cops8Q8VBV7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cops8Q8VBV7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cops8Q8VBV7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cops8Q8VBV7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cops8Q8VBV7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cops8Q8VBV7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cops8Q8VBV7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cops8Q8VBV7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cops8Q8VBV7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cops8Q8VBV7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cops8Q8VBV7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cops8Q8VBV7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cops8Q8VBV7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cops8Q8VBV7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cops8Q8VBV7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cops8Q8VBV7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cops8Q8VBV7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cops8Q8VBV7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cops8Q8VBV7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cops8Q8VBV7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cops8Q8VBV7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cops8Q8VBV7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cops8Q8VBV7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cops8Q8VBV7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cops8Q8VBV7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cops8Q8VBV7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cops8Q8VBV7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cops8Q8VBV7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cops8Q8VBV7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cops8Q8VBV7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cops8Q8VBV7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cops8Q8VBV7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cops8Q8VBV7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cops8Q8VBV7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cops8Q8VBV7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cops8Q8VBV7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cops8Q8VBV7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cops8Q8VBV7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cops8Q8VBV7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cops8Q8VBV7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cops8Q8VBV7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cops8Q8VBV7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cops8Q8VBV7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cops8Q8VBV7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cops8Q8VBV7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cops8Q8VBV7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cops8Q8VBV7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cops8Q8VBV7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cops8Q8VBV7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cops8Q8VBV7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cops8Q8VBV7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cops8Q8VBV7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cops8Q8VBV7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cops8Q8VBV7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cops8Q8VBV7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cops8Q8VBV7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cops8Q8VBV7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cops8Q8VBV7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cops8Q8VBV7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cops8Q8VBV7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cops8Q8VBV7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cops8Q8VBV7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cops8Q8VBV7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms