Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ApobrQ8VBT6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ApobrQ8VBT6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ApobrQ8VBT6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ApobrQ8VBT6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ApobrQ8VBT6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ApobrQ8VBT6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ApobrQ8VBT6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ApobrQ8VBT6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ApobrQ8VBT6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ApobrQ8VBT6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ApobrQ8VBT6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ApobrQ8VBT6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ApobrQ8VBT6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ApobrQ8VBT6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ApobrQ8VBT6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ApobrQ8VBT6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ApobrQ8VBT6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ApobrQ8VBT6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ApobrQ8VBT6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ApobrQ8VBT6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ApobrQ8VBT6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ApobrQ8VBT6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ApobrQ8VBT6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ApobrQ8VBT6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ApobrQ8VBT6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ApobrQ8VBT6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ApobrQ8VBT6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ApobrQ8VBT6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ApobrQ8VBT6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
ApobrQ8VBT6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ApobrQ8VBT6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ApobrQ8VBT6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ApobrQ8VBT6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ApobrQ8VBT6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ApobrQ8VBT6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ApobrQ8VBT6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
ApobrQ8VBT6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ApobrQ8VBT6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ApobrQ8VBT6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ApobrQ8VBT6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ApobrQ8VBT6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ApobrQ8VBT6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ApobrQ8VBT6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ApobrQ8VBT6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ApobrQ8VBT6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ApobrQ8VBT6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ApobrQ8VBT6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ApobrQ8VBT6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ApobrQ8VBT6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ApobrQ8VBT6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ApobrQ8VBT6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ApobrQ8VBT6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ApobrQ8VBT6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ApobrQ8VBT6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ApobrQ8VBT6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ApobrQ8VBT6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ApobrQ8VBT6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ApobrQ8VBT6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ApobrQ8VBT6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ApobrQ8VBT6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ApobrQ8VBT6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ApobrQ8VBT6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ApobrQ8VBT6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ApobrQ8VBT6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ApobrQ8VBT6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ApobrQ8VBT6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ApobrQ8VBT6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ApobrQ8VBT6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ApobrQ8VBT6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ApobrQ8VBT6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ApobrQ8VBT6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ApobrQ8VBT6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ApobrQ8VBT6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ApobrQ8VBT6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ApobrQ8VBT6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ApobrQ8VBT6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ApobrQ8VBT6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ApobrQ8VBT6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ApobrQ8VBT6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ApobrQ8VBT6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ApobrQ8VBT6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ApobrQ8VBT6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
ApobrQ8VBT6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ApobrQ8VBT6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ApobrQ8VBT6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ApobrQ8VBT6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ApobrQ8VBT6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ApobrQ8VBT6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ApobrQ8VBT6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ApobrQ8VBT6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ApobrQ8VBT6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ApobrQ8VBT6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ApobrQ8VBT6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ApobrQ8VBT6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ApobrQ8VBT6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ApobrQ8VBT6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ApobrQ8VBT6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ApobrQ8VBT6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ApobrQ8VBT6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms