Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup58Q8R332 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup58Q8R332 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup58Q8R332 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nup58Q8R332 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nup58Q8R332 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nup58Q8R332 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Nup58Q8R332 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nup58Q8R332 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup58Q8R332 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup58Q8R332 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup58Q8R332 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup58Q8R332 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup58Q8R332 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup58Q8R332 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup58Q8R332 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup58Q8R332 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nup58Q8R332 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nup58Q8R332 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nup58Q8R332 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nup58Q8R332 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nup58Q8R332 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nup58Q8R332 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup58Q8R332 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup58Q8R332 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup58Q8R332 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup58Q8R332 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup58Q8R332 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup58Q8R332 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup58Q8R332 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup58Q8R332 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup58Q8R332 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nup58Q8R332 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nup58Q8R332 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nup58Q8R332 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup58Q8R332 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup58Q8R332 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup58Q8R332 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup58Q8R332 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup58Q8R332 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup58Q8R332 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup58Q8R332 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup58Q8R332 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup58Q8R332 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup58Q8R332 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup58Q8R332 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup58Q8R332 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup58Q8R332 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup58Q8R332 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup58Q8R332 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup58Q8R332 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup58Q8R332 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup58Q8R332 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup58Q8R332 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup58Q8R332 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup58Q8R332 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup58Q8R332 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup58Q8R332 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nup58Q8R332 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nup58Q8R332 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nup58Q8R332 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nup58Q8R332 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nup58Q8R332 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup58Q8R332 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup58Q8R332 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup58Q8R332 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup58Q8R332 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup58Q8R332 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup58Q8R332 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup58Q8R332 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup58Q8R332 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup58Q8R332 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup58Q8R332 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup58Q8R332 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup58Q8R332 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup58Q8R332 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup58Q8R332 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup58Q8R332 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup58Q8R332 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup58Q8R332 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup58Q8R332 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup58Q8R332 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup58Q8R332 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nup58Q8R332 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nup58Q8R332 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nup58Q8R332 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nup58Q8R332 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nup58Q8R332 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nup58Q8R332 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nup58Q8R332 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup58Q8R332 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup58Q8R332 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup58Q8R332 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup58Q8R332 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup58Q8R332 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup58Q8R332 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Nup58Q8R332 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nup58Q8R332 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nup58Q8R332 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Nup58Q8R332 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms