Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Hecw1Q8K4P8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Hecw1Q8K4P8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Hecw1Q8K4P8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Hecw1Q8K4P8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Hecw1Q8K4P8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Hecw1Q8K4P8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Hecw1Q8K4P8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Hecw1Q8K4P8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Hecw1Q8K4P8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Hecw1Q8K4P8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Hecw1Q8K4P8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Hecw1Q8K4P8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Hecw1Q8K4P8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Hecw1Q8K4P8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Hecw1Q8K4P8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Hecw1Q8K4P8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Hecw1Q8K4P8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Hecw1Q8K4P8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Hecw1Q8K4P8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Hecw1Q8K4P8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Hecw1Q8K4P8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Hecw1Q8K4P8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Hecw1Q8K4P8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Hecw1Q8K4P8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Hecw1Q8K4P8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Hecw1Q8K4P8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Hecw1Q8K4P8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Hecw1Q8K4P8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Hecw1Q8K4P8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Hecw1Q8K4P8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Hecw1Q8K4P8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Hecw1Q8K4P8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Hecw1Q8K4P8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Hecw1Q8K4P8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Hecw1Q8K4P8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Hecw1Q8K4P8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Hecw1Q8K4P8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Hecw1Q8K4P8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Hecw1Q8K4P8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Hecw1Q8K4P8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Hecw1Q8K4P8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Hecw1Q8K4P8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Hecw1Q8K4P8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Hecw1Q8K4P8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Hecw1Q8K4P8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Hecw1Q8K4P8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Hecw1Q8K4P8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Hecw1Q8K4P8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Hecw1Q8K4P8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Hecw1Q8K4P8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Hecw1Q8K4P8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Hecw1Q8K4P8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Hecw1Q8K4P8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Hecw1Q8K4P8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Hecw1Q8K4P8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Hecw1Q8K4P8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Hecw1Q8K4P8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Hecw1Q8K4P8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Hecw1Q8K4P8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Hecw1Q8K4P8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Hecw1Q8K4P8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Hecw1Q8K4P8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Hecw1Q8K4P8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Hecw1Q8K4P8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Hecw1Q8K4P8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Hecw1Q8K4P8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Hecw1Q8K4P8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
Hecw1Q8K4P8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Hecw1Q8K4P8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Hecw1Q8K4P8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Hecw1Q8K4P8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Hecw1Q8K4P8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Hecw1Q8K4P8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Hecw1Q8K4P8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Hecw1Q8K4P8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Hecw1Q8K4P8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Hecw1Q8K4P8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Hecw1Q8K4P8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Hecw1Q8K4P8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Hecw1Q8K4P8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Hecw1Q8K4P8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Hecw1Q8K4P8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Hecw1Q8K4P8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Hecw1Q8K4P8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Hecw1Q8K4P8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Hecw1Q8K4P8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Hecw1Q8K4P8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Hecw1Q8K4P8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Hecw1Q8K4P8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Hecw1Q8K4P8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Hecw1Q8K4P8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Hecw1Q8K4P8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Hecw1Q8K4P8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Hecw1Q8K4P8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Hecw1Q8K4P8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Hecw1Q8K4P8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Hecw1Q8K4P8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Hecw1Q8K4P8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Hecw1Q8K4P8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 298.8 ms