Protein–RNA interactions for Protein: Q8K411

Pitrm1, Presequence protease, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitrm1Q8K411 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pitrm1Q8K411 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pitrm1Q8K411 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pitrm1Q8K411 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pitrm1Q8K411 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pitrm1Q8K411 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pitrm1Q8K411 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pitrm1Q8K411 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pitrm1Q8K411 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pitrm1Q8K411 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pitrm1Q8K411 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pitrm1Q8K411 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pitrm1Q8K411 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pitrm1Q8K411 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pitrm1Q8K411 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pitrm1Q8K411 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pitrm1Q8K411 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pitrm1Q8K411 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pitrm1Q8K411 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pitrm1Q8K411 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pitrm1Q8K411 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pitrm1Q8K411 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pitrm1Q8K411 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pitrm1Q8K411 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pitrm1Q8K411 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pitrm1Q8K411 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pitrm1Q8K411 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pitrm1Q8K411 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pitrm1Q8K411 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pitrm1Q8K411 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pitrm1Q8K411 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pitrm1Q8K411 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pitrm1Q8K411 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pitrm1Q8K411 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pitrm1Q8K411 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pitrm1Q8K411 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pitrm1Q8K411 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pitrm1Q8K411 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pitrm1Q8K411 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pitrm1Q8K411 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pitrm1Q8K411 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pitrm1Q8K411 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pitrm1Q8K411 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pitrm1Q8K411 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pitrm1Q8K411 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pitrm1Q8K411 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pitrm1Q8K411 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pitrm1Q8K411 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pitrm1Q8K411 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pitrm1Q8K411 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pitrm1Q8K411 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pitrm1Q8K411 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pitrm1Q8K411 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pitrm1Q8K411 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pitrm1Q8K411 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pitrm1Q8K411 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pitrm1Q8K411 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pitrm1Q8K411 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pitrm1Q8K411 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pitrm1Q8K411 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pitrm1Q8K411 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pitrm1Q8K411 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pitrm1Q8K411 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pitrm1Q8K411 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pitrm1Q8K411 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pitrm1Q8K411 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pitrm1Q8K411 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pitrm1Q8K411 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pitrm1Q8K411 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pitrm1Q8K411 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pitrm1Q8K411 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pitrm1Q8K411 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pitrm1Q8K411 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pitrm1Q8K411 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pitrm1Q8K411 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pitrm1Q8K411 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pitrm1Q8K411 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pitrm1Q8K411 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pitrm1Q8K411 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pitrm1Q8K411 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pitrm1Q8K411 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pitrm1Q8K411 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pitrm1Q8K411 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pitrm1Q8K411 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pitrm1Q8K411 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pitrm1Q8K411 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Pitrm1Q8K411 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pitrm1Q8K411 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pitrm1Q8K411 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pitrm1Q8K411 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pitrm1Q8K411 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pitrm1Q8K411 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pitrm1Q8K411 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pitrm1Q8K411 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pitrm1Q8K411 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pitrm1Q8K411 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pitrm1Q8K411 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pitrm1Q8K411 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pitrm1Q8K411 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pitrm1Q8K411 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.7 ms