Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z8

Ube2q2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q2, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q2Q8K2Z8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ube2q2Q8K2Z8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ube2q2Q8K2Z8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ube2q2Q8K2Z8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ube2q2Q8K2Z8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ube2q2Q8K2Z8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ube2q2Q8K2Z8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ube2q2Q8K2Z8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ube2q2Q8K2Z8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ube2q2Q8K2Z8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ube2q2Q8K2Z8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ube2q2Q8K2Z8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ube2q2Q8K2Z8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ube2q2Q8K2Z8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ube2q2Q8K2Z8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ube2q2Q8K2Z8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ube2q2Q8K2Z8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ube2q2Q8K2Z8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ube2q2Q8K2Z8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ube2q2Q8K2Z8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ube2q2Q8K2Z8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ube2q2Q8K2Z8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ube2q2Q8K2Z8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ube2q2Q8K2Z8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ube2q2Q8K2Z8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ube2q2Q8K2Z8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ube2q2Q8K2Z8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ube2q2Q8K2Z8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ube2q2Q8K2Z8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ube2q2Q8K2Z8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ube2q2Q8K2Z8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ube2q2Q8K2Z8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ube2q2Q8K2Z8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ube2q2Q8K2Z8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ube2q2Q8K2Z8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ube2q2Q8K2Z8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ube2q2Q8K2Z8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ube2q2Q8K2Z8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ube2q2Q8K2Z8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ube2q2Q8K2Z8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ube2q2Q8K2Z8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ube2q2Q8K2Z8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ube2q2Q8K2Z8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ube2q2Q8K2Z8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ube2q2Q8K2Z8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ube2q2Q8K2Z8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ube2q2Q8K2Z8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ube2q2Q8K2Z8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ube2q2Q8K2Z8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ube2q2Q8K2Z8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ube2q2Q8K2Z8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ube2q2Q8K2Z8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ube2q2Q8K2Z8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ube2q2Q8K2Z8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ube2q2Q8K2Z8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ube2q2Q8K2Z8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ube2q2Q8K2Z8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ube2q2Q8K2Z8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ube2q2Q8K2Z8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ube2q2Q8K2Z8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ube2q2Q8K2Z8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ube2q2Q8K2Z8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ube2q2Q8K2Z8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ube2q2Q8K2Z8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ube2q2Q8K2Z8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ube2q2Q8K2Z8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ube2q2Q8K2Z8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube2q2Q8K2Z8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube2q2Q8K2Z8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube2q2Q8K2Z8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube2q2Q8K2Z8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube2q2Q8K2Z8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube2q2Q8K2Z8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube2q2Q8K2Z8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube2q2Q8K2Z8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube2q2Q8K2Z8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube2q2Q8K2Z8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube2q2Q8K2Z8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube2q2Q8K2Z8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube2q2Q8K2Z8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube2q2Q8K2Z8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube2q2Q8K2Z8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube2q2Q8K2Z8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube2q2Q8K2Z8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube2q2Q8K2Z8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube2q2Q8K2Z8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube2q2Q8K2Z8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube2q2Q8K2Z8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube2q2Q8K2Z8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube2q2Q8K2Z8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube2q2Q8K2Z8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ube2q2Q8K2Z8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ube2q2Q8K2Z8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ube2q2Q8K2Z8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube2q2Q8K2Z8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube2q2Q8K2Z8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube2q2Q8K2Z8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube2q2Q8K2Z8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube2q2Q8K2Z8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube2q2Q8K2Z8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms