Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ27

Aspm, Abnormal spindle-like microcephaly-associated protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AspmQ8CJ27 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AspmQ8CJ27 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AspmQ8CJ27 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AspmQ8CJ27 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AspmQ8CJ27 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AspmQ8CJ27 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AspmQ8CJ27 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AspmQ8CJ27 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AspmQ8CJ27 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AspmQ8CJ27 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AspmQ8CJ27 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AspmQ8CJ27 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AspmQ8CJ27 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AspmQ8CJ27 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AspmQ8CJ27 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AspmQ8CJ27 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AspmQ8CJ27 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AspmQ8CJ27 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AspmQ8CJ27 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
AspmQ8CJ27 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AspmQ8CJ27 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AspmQ8CJ27 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AspmQ8CJ27 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AspmQ8CJ27 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AspmQ8CJ27 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
AspmQ8CJ27 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AspmQ8CJ27 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AspmQ8CJ27 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AspmQ8CJ27 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AspmQ8CJ27 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AspmQ8CJ27 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
AspmQ8CJ27 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
AspmQ8CJ27 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AspmQ8CJ27 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AspmQ8CJ27 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AspmQ8CJ27 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AspmQ8CJ27 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AspmQ8CJ27 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
AspmQ8CJ27 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AspmQ8CJ27 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AspmQ8CJ27 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AspmQ8CJ27 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AspmQ8CJ27 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
AspmQ8CJ27 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AspmQ8CJ27 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AspmQ8CJ27 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AspmQ8CJ27 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
AspmQ8CJ27 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
AspmQ8CJ27 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AspmQ8CJ27 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AspmQ8CJ27 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AspmQ8CJ27 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
AspmQ8CJ27 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AspmQ8CJ27 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AspmQ8CJ27 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AspmQ8CJ27 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AspmQ8CJ27 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AspmQ8CJ27 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AspmQ8CJ27 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AspmQ8CJ27 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AspmQ8CJ27 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AspmQ8CJ27 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AspmQ8CJ27 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AspmQ8CJ27 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AspmQ8CJ27 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AspmQ8CJ27 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AspmQ8CJ27 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AspmQ8CJ27 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AspmQ8CJ27 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AspmQ8CJ27 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AspmQ8CJ27 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AspmQ8CJ27 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AspmQ8CJ27 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
AspmQ8CJ27 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AspmQ8CJ27 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AspmQ8CJ27 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AspmQ8CJ27 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
AspmQ8CJ27 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AspmQ8CJ27 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AspmQ8CJ27 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AspmQ8CJ27 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AspmQ8CJ27 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AspmQ8CJ27 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AspmQ8CJ27 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AspmQ8CJ27 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AspmQ8CJ27 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AspmQ8CJ27 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AspmQ8CJ27 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AspmQ8CJ27 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AspmQ8CJ27 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AspmQ8CJ27 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AspmQ8CJ27 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AspmQ8CJ27 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AspmQ8CJ27 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AspmQ8CJ27 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AspmQ8CJ27 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AspmQ8CJ27 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AspmQ8CJ27 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AspmQ8CJ27 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AspmQ8CJ27 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms