Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csnka2ipQ8CH19 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csnka2ipQ8CH19 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csnka2ipQ8CH19 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csnka2ipQ8CH19 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csnka2ipQ8CH19 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csnka2ipQ8CH19 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csnka2ipQ8CH19 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Csnka2ipQ8CH19 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Csnka2ipQ8CH19 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Csnka2ipQ8CH19 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Csnka2ipQ8CH19 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csnka2ipQ8CH19 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csnka2ipQ8CH19 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Csnka2ipQ8CH19 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Csnka2ipQ8CH19 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csnka2ipQ8CH19 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csnka2ipQ8CH19 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Csnka2ipQ8CH19 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Csnka2ipQ8CH19 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csnka2ipQ8CH19 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csnka2ipQ8CH19 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csnka2ipQ8CH19 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csnka2ipQ8CH19 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Csnka2ipQ8CH19 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csnka2ipQ8CH19 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csnka2ipQ8CH19 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csnka2ipQ8CH19 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csnka2ipQ8CH19 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csnka2ipQ8CH19 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csnka2ipQ8CH19 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csnka2ipQ8CH19 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csnka2ipQ8CH19 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csnka2ipQ8CH19 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csnka2ipQ8CH19 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Csnka2ipQ8CH19 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csnka2ipQ8CH19 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csnka2ipQ8CH19 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csnka2ipQ8CH19 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csnka2ipQ8CH19 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csnka2ipQ8CH19 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csnka2ipQ8CH19 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csnka2ipQ8CH19 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csnka2ipQ8CH19 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csnka2ipQ8CH19 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csnka2ipQ8CH19 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csnka2ipQ8CH19 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csnka2ipQ8CH19 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csnka2ipQ8CH19 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csnka2ipQ8CH19 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Csnka2ipQ8CH19 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Csnka2ipQ8CH19 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csnka2ipQ8CH19 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Csnka2ipQ8CH19 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Csnka2ipQ8CH19 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csnka2ipQ8CH19 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Csnka2ipQ8CH19 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Csnka2ipQ8CH19 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csnka2ipQ8CH19 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csnka2ipQ8CH19 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Csnka2ipQ8CH19 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csnka2ipQ8CH19 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Csnka2ipQ8CH19 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csnka2ipQ8CH19 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Csnka2ipQ8CH19 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csnka2ipQ8CH19 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Csnka2ipQ8CH19 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csnka2ipQ8CH19 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csnka2ipQ8CH19 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csnka2ipQ8CH19 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csnka2ipQ8CH19 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csnka2ipQ8CH19 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csnka2ipQ8CH19 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csnka2ipQ8CH19 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csnka2ipQ8CH19 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csnka2ipQ8CH19 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csnka2ipQ8CH19 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csnka2ipQ8CH19 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csnka2ipQ8CH19 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csnka2ipQ8CH19 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Csnka2ipQ8CH19 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csnka2ipQ8CH19 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csnka2ipQ8CH19 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csnka2ipQ8CH19 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csnka2ipQ8CH19 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csnka2ipQ8CH19 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csnka2ipQ8CH19 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csnka2ipQ8CH19 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csnka2ipQ8CH19 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csnka2ipQ8CH19 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csnka2ipQ8CH19 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csnka2ipQ8CH19 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csnka2ipQ8CH19 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csnka2ipQ8CH19 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csnka2ipQ8CH19 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csnka2ipQ8CH19 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Csnka2ipQ8CH19 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csnka2ipQ8CH19 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csnka2ipQ8CH19 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csnka2ipQ8CH19 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms