Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGZ0

Cherp, Calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CherpQ8CGZ0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CherpQ8CGZ0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CherpQ8CGZ0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CherpQ8CGZ0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CherpQ8CGZ0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CherpQ8CGZ0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CherpQ8CGZ0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CherpQ8CGZ0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CherpQ8CGZ0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CherpQ8CGZ0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CherpQ8CGZ0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CherpQ8CGZ0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CherpQ8CGZ0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CherpQ8CGZ0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CherpQ8CGZ0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CherpQ8CGZ0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CherpQ8CGZ0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CherpQ8CGZ0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CherpQ8CGZ0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CherpQ8CGZ0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CherpQ8CGZ0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CherpQ8CGZ0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CherpQ8CGZ0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CherpQ8CGZ0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CherpQ8CGZ0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CherpQ8CGZ0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CherpQ8CGZ0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CherpQ8CGZ0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CherpQ8CGZ0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CherpQ8CGZ0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CherpQ8CGZ0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CherpQ8CGZ0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CherpQ8CGZ0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CherpQ8CGZ0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CherpQ8CGZ0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CherpQ8CGZ0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CherpQ8CGZ0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CherpQ8CGZ0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CherpQ8CGZ0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CherpQ8CGZ0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CherpQ8CGZ0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CherpQ8CGZ0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CherpQ8CGZ0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CherpQ8CGZ0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CherpQ8CGZ0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CherpQ8CGZ0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CherpQ8CGZ0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CherpQ8CGZ0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CherpQ8CGZ0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CherpQ8CGZ0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CherpQ8CGZ0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CherpQ8CGZ0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CherpQ8CGZ0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CherpQ8CGZ0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CherpQ8CGZ0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CherpQ8CGZ0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CherpQ8CGZ0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CherpQ8CGZ0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CherpQ8CGZ0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CherpQ8CGZ0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CherpQ8CGZ0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CherpQ8CGZ0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CherpQ8CGZ0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CherpQ8CGZ0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CherpQ8CGZ0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CherpQ8CGZ0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CherpQ8CGZ0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CherpQ8CGZ0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CherpQ8CGZ0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CherpQ8CGZ0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CherpQ8CGZ0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CherpQ8CGZ0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CherpQ8CGZ0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CherpQ8CGZ0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CherpQ8CGZ0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CherpQ8CGZ0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CherpQ8CGZ0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CherpQ8CGZ0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CherpQ8CGZ0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CherpQ8CGZ0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CherpQ8CGZ0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CherpQ8CGZ0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CherpQ8CGZ0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CherpQ8CGZ0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CherpQ8CGZ0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CherpQ8CGZ0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CherpQ8CGZ0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CherpQ8CGZ0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CherpQ8CGZ0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CherpQ8CGZ0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CherpQ8CGZ0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CherpQ8CGZ0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CherpQ8CGZ0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CherpQ8CGZ0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CherpQ8CGZ0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CherpQ8CGZ0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CherpQ8CGZ0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CherpQ8CGZ0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CherpQ8CGZ0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CherpQ8CGZ0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms