Protein–RNA interactions for Protein: Q8CG27

Actl9, Actin-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actl9Q8CG27 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Actl9Q8CG27 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Actl9Q8CG27 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Actl9Q8CG27 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Actl9Q8CG27 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Actl9Q8CG27 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Actl9Q8CG27 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Actl9Q8CG27 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Actl9Q8CG27 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Actl9Q8CG27 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Actl9Q8CG27 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Actl9Q8CG27 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Actl9Q8CG27 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Actl9Q8CG27 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Actl9Q8CG27 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Actl9Q8CG27 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Actl9Q8CG27 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Actl9Q8CG27 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Actl9Q8CG27 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Actl9Q8CG27 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Actl9Q8CG27 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Actl9Q8CG27 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Actl9Q8CG27 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Actl9Q8CG27 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Actl9Q8CG27 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Actl9Q8CG27 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Actl9Q8CG27 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Actl9Q8CG27 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Actl9Q8CG27 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Actl9Q8CG27 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Actl9Q8CG27 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Actl9Q8CG27 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Actl9Q8CG27 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Actl9Q8CG27 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Actl9Q8CG27 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Actl9Q8CG27 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Actl9Q8CG27 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Actl9Q8CG27 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Actl9Q8CG27 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Actl9Q8CG27 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Actl9Q8CG27 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Actl9Q8CG27 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Actl9Q8CG27 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Actl9Q8CG27 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Actl9Q8CG27 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Actl9Q8CG27 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Actl9Q8CG27 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Actl9Q8CG27 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Actl9Q8CG27 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Actl9Q8CG27 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Actl9Q8CG27 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Actl9Q8CG27 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Actl9Q8CG27 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Actl9Q8CG27 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Actl9Q8CG27 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Actl9Q8CG27 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Actl9Q8CG27 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Actl9Q8CG27 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Actl9Q8CG27 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Actl9Q8CG27 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Actl9Q8CG27 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Actl9Q8CG27 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Actl9Q8CG27 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Actl9Q8CG27 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Actl9Q8CG27 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Actl9Q8CG27 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Actl9Q8CG27 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Actl9Q8CG27 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Actl9Q8CG27 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Actl9Q8CG27 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Actl9Q8CG27 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Actl9Q8CG27 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Actl9Q8CG27 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Actl9Q8CG27 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Actl9Q8CG27 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Actl9Q8CG27 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Actl9Q8CG27 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Actl9Q8CG27 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Actl9Q8CG27 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Actl9Q8CG27 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Actl9Q8CG27 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Actl9Q8CG27 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Actl9Q8CG27 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Actl9Q8CG27 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Actl9Q8CG27 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Actl9Q8CG27 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Actl9Q8CG27 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Actl9Q8CG27 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Actl9Q8CG27 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Actl9Q8CG27 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Actl9Q8CG27 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Actl9Q8CG27 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Actl9Q8CG27 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Actl9Q8CG27 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Actl9Q8CG27 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Actl9Q8CG27 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Actl9Q8CG27 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Actl9Q8CG27 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Actl9Q8CG27 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Actl9Q8CG27 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms