Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rdh13Q8CEE7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rdh13Q8CEE7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rdh13Q8CEE7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rdh13Q8CEE7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rdh13Q8CEE7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rdh13Q8CEE7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rdh13Q8CEE7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rdh13Q8CEE7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rdh13Q8CEE7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rdh13Q8CEE7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rdh13Q8CEE7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rdh13Q8CEE7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rdh13Q8CEE7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rdh13Q8CEE7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rdh13Q8CEE7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rdh13Q8CEE7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rdh13Q8CEE7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rdh13Q8CEE7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rdh13Q8CEE7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rdh13Q8CEE7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rdh13Q8CEE7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rdh13Q8CEE7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rdh13Q8CEE7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rdh13Q8CEE7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rdh13Q8CEE7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rdh13Q8CEE7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rdh13Q8CEE7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rdh13Q8CEE7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rdh13Q8CEE7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rdh13Q8CEE7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rdh13Q8CEE7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rdh13Q8CEE7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rdh13Q8CEE7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rdh13Q8CEE7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rdh13Q8CEE7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rdh13Q8CEE7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rdh13Q8CEE7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rdh13Q8CEE7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rdh13Q8CEE7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rdh13Q8CEE7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rdh13Q8CEE7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rdh13Q8CEE7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rdh13Q8CEE7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rdh13Q8CEE7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rdh13Q8CEE7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Rdh13Q8CEE7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Rdh13Q8CEE7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rdh13Q8CEE7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rdh13Q8CEE7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rdh13Q8CEE7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rdh13Q8CEE7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rdh13Q8CEE7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rdh13Q8CEE7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rdh13Q8CEE7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rdh13Q8CEE7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rdh13Q8CEE7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rdh13Q8CEE7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rdh13Q8CEE7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rdh13Q8CEE7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rdh13Q8CEE7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rdh13Q8CEE7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rdh13Q8CEE7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rdh13Q8CEE7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Rdh13Q8CEE7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rdh13Q8CEE7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rdh13Q8CEE7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rdh13Q8CEE7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rdh13Q8CEE7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rdh13Q8CEE7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rdh13Q8CEE7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rdh13Q8CEE7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rdh13Q8CEE7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rdh13Q8CEE7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rdh13Q8CEE7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rdh13Q8CEE7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rdh13Q8CEE7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rdh13Q8CEE7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rdh13Q8CEE7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rdh13Q8CEE7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rdh13Q8CEE7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rdh13Q8CEE7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rdh13Q8CEE7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rdh13Q8CEE7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rdh13Q8CEE7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rdh13Q8CEE7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rdh13Q8CEE7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rdh13Q8CEE7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rdh13Q8CEE7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rdh13Q8CEE7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rdh13Q8CEE7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rdh13Q8CEE7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rdh13Q8CEE7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rdh13Q8CEE7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rdh13Q8CEE7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rdh13Q8CEE7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.5 ms