Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
E4f1Q8CCE9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
E4f1Q8CCE9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
E4f1Q8CCE9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
E4f1Q8CCE9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
E4f1Q8CCE9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
E4f1Q8CCE9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
E4f1Q8CCE9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
E4f1Q8CCE9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
E4f1Q8CCE9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
E4f1Q8CCE9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
E4f1Q8CCE9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
E4f1Q8CCE9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
E4f1Q8CCE9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
E4f1Q8CCE9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
E4f1Q8CCE9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
E4f1Q8CCE9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
E4f1Q8CCE9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
E4f1Q8CCE9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
E4f1Q8CCE9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
E4f1Q8CCE9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
E4f1Q8CCE9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
E4f1Q8CCE9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
E4f1Q8CCE9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
E4f1Q8CCE9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
E4f1Q8CCE9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
E4f1Q8CCE9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
E4f1Q8CCE9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
E4f1Q8CCE9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
E4f1Q8CCE9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
E4f1Q8CCE9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
E4f1Q8CCE9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
E4f1Q8CCE9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
E4f1Q8CCE9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
E4f1Q8CCE9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
E4f1Q8CCE9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
E4f1Q8CCE9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
E4f1Q8CCE9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
E4f1Q8CCE9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
E4f1Q8CCE9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
E4f1Q8CCE9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
E4f1Q8CCE9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
E4f1Q8CCE9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
E4f1Q8CCE9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
E4f1Q8CCE9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
E4f1Q8CCE9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
E4f1Q8CCE9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
E4f1Q8CCE9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
E4f1Q8CCE9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
E4f1Q8CCE9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
E4f1Q8CCE9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
E4f1Q8CCE9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
E4f1Q8CCE9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
E4f1Q8CCE9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
E4f1Q8CCE9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
E4f1Q8CCE9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
E4f1Q8CCE9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
E4f1Q8CCE9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
E4f1Q8CCE9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
E4f1Q8CCE9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
E4f1Q8CCE9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
E4f1Q8CCE9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
E4f1Q8CCE9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
E4f1Q8CCE9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
E4f1Q8CCE9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
E4f1Q8CCE9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
E4f1Q8CCE9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
E4f1Q8CCE9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
E4f1Q8CCE9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
E4f1Q8CCE9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
E4f1Q8CCE9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
E4f1Q8CCE9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
E4f1Q8CCE9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
E4f1Q8CCE9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
E4f1Q8CCE9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
E4f1Q8CCE9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
E4f1Q8CCE9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
E4f1Q8CCE9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
E4f1Q8CCE9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
E4f1Q8CCE9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
E4f1Q8CCE9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
E4f1Q8CCE9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
E4f1Q8CCE9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
E4f1Q8CCE9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
E4f1Q8CCE9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
E4f1Q8CCE9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
E4f1Q8CCE9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
E4f1Q8CCE9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
E4f1Q8CCE9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
E4f1Q8CCE9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
E4f1Q8CCE9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
E4f1Q8CCE9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
E4f1Q8CCE9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
E4f1Q8CCE9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
E4f1Q8CCE9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
E4f1Q8CCE9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
E4f1Q8CCE9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
E4f1Q8CCE9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
E4f1Q8CCE9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
E4f1Q8CCE9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms