Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY1

Samd4a, Protein Smaug homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4aQ8CBY1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Samd4aQ8CBY1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Samd4aQ8CBY1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Samd4aQ8CBY1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Samd4aQ8CBY1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Samd4aQ8CBY1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Samd4aQ8CBY1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Samd4aQ8CBY1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Samd4aQ8CBY1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Samd4aQ8CBY1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Samd4aQ8CBY1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Samd4aQ8CBY1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Samd4aQ8CBY1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Samd4aQ8CBY1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Samd4aQ8CBY1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Samd4aQ8CBY1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Samd4aQ8CBY1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Samd4aQ8CBY1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Samd4aQ8CBY1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Samd4aQ8CBY1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Samd4aQ8CBY1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samd4aQ8CBY1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samd4aQ8CBY1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Samd4aQ8CBY1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Samd4aQ8CBY1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Samd4aQ8CBY1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Samd4aQ8CBY1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Samd4aQ8CBY1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Samd4aQ8CBY1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Samd4aQ8CBY1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Samd4aQ8CBY1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Samd4aQ8CBY1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Samd4aQ8CBY1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Samd4aQ8CBY1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Samd4aQ8CBY1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Samd4aQ8CBY1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Samd4aQ8CBY1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Samd4aQ8CBY1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Samd4aQ8CBY1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Samd4aQ8CBY1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Samd4aQ8CBY1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Samd4aQ8CBY1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samd4aQ8CBY1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samd4aQ8CBY1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samd4aQ8CBY1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Samd4aQ8CBY1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samd4aQ8CBY1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samd4aQ8CBY1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samd4aQ8CBY1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Samd4aQ8CBY1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samd4aQ8CBY1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samd4aQ8CBY1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samd4aQ8CBY1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samd4aQ8CBY1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samd4aQ8CBY1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Samd4aQ8CBY1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samd4aQ8CBY1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samd4aQ8CBY1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samd4aQ8CBY1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samd4aQ8CBY1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samd4aQ8CBY1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samd4aQ8CBY1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samd4aQ8CBY1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samd4aQ8CBY1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samd4aQ8CBY1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samd4aQ8CBY1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samd4aQ8CBY1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samd4aQ8CBY1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samd4aQ8CBY1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samd4aQ8CBY1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samd4aQ8CBY1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samd4aQ8CBY1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samd4aQ8CBY1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samd4aQ8CBY1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms