Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CntrobQ8CB62 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CntrobQ8CB62 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CntrobQ8CB62 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CntrobQ8CB62 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CntrobQ8CB62 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CntrobQ8CB62 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CntrobQ8CB62 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CntrobQ8CB62 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CntrobQ8CB62 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CntrobQ8CB62 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CntrobQ8CB62 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CntrobQ8CB62 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CntrobQ8CB62 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CntrobQ8CB62 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CntrobQ8CB62 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CntrobQ8CB62 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CntrobQ8CB62 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CntrobQ8CB62 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CntrobQ8CB62 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CntrobQ8CB62 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CntrobQ8CB62 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CntrobQ8CB62 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CntrobQ8CB62 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CntrobQ8CB62 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CntrobQ8CB62 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CntrobQ8CB62 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CntrobQ8CB62 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CntrobQ8CB62 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CntrobQ8CB62 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CntrobQ8CB62 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CntrobQ8CB62 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CntrobQ8CB62 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CntrobQ8CB62 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CntrobQ8CB62 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CntrobQ8CB62 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CntrobQ8CB62 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CntrobQ8CB62 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CntrobQ8CB62 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CntrobQ8CB62 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CntrobQ8CB62 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CntrobQ8CB62 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CntrobQ8CB62 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CntrobQ8CB62 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CntrobQ8CB62 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CntrobQ8CB62 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CntrobQ8CB62 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CntrobQ8CB62 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CntrobQ8CB62 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CntrobQ8CB62 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CntrobQ8CB62 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CntrobQ8CB62 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CntrobQ8CB62 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CntrobQ8CB62 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CntrobQ8CB62 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CntrobQ8CB62 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CntrobQ8CB62 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CntrobQ8CB62 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CntrobQ8CB62 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CntrobQ8CB62 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CntrobQ8CB62 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CntrobQ8CB62 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CntrobQ8CB62 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CntrobQ8CB62 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CntrobQ8CB62 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CntrobQ8CB62 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CntrobQ8CB62 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CntrobQ8CB62 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CntrobQ8CB62 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CntrobQ8CB62 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CntrobQ8CB62 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CntrobQ8CB62 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CntrobQ8CB62 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CntrobQ8CB62 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CntrobQ8CB62 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CntrobQ8CB62 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CntrobQ8CB62 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CntrobQ8CB62 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CntrobQ8CB62 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CntrobQ8CB62 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CntrobQ8CB62 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CntrobQ8CB62 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CntrobQ8CB62 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CntrobQ8CB62 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CntrobQ8CB62 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CntrobQ8CB62 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CntrobQ8CB62 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CntrobQ8CB62 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CntrobQ8CB62 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CntrobQ8CB62 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CntrobQ8CB62 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CntrobQ8CB62 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CntrobQ8CB62 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CntrobQ8CB62 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CntrobQ8CB62 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CntrobQ8CB62 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CntrobQ8CB62 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CntrobQ8CB62 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CntrobQ8CB62 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CntrobQ8CB62 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms