Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Spef2Q8C9J3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Spef2Q8C9J3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Spef2Q8C9J3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Spef2Q8C9J3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Spef2Q8C9J3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Spef2Q8C9J3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Spef2Q8C9J3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Spef2Q8C9J3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Spef2Q8C9J3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Spef2Q8C9J3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Spef2Q8C9J3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Spef2Q8C9J3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Spef2Q8C9J3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Spef2Q8C9J3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Spef2Q8C9J3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Spef2Q8C9J3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Spef2Q8C9J3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Spef2Q8C9J3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Spef2Q8C9J3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Spef2Q8C9J3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Spef2Q8C9J3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Spef2Q8C9J3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Spef2Q8C9J3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Spef2Q8C9J3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Spef2Q8C9J3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Spef2Q8C9J3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Spef2Q8C9J3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Spef2Q8C9J3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Spef2Q8C9J3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Spef2Q8C9J3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Spef2Q8C9J3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Spef2Q8C9J3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Spef2Q8C9J3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Spef2Q8C9J3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Spef2Q8C9J3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Spef2Q8C9J3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Spef2Q8C9J3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Spef2Q8C9J3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Spef2Q8C9J3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Spef2Q8C9J3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Spef2Q8C9J3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Spef2Q8C9J3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Spef2Q8C9J3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Spef2Q8C9J3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Spef2Q8C9J3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Spef2Q8C9J3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Spef2Q8C9J3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Spef2Q8C9J3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Spef2Q8C9J3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Spef2Q8C9J3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Spef2Q8C9J3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Spef2Q8C9J3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Spef2Q8C9J3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Spef2Q8C9J3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Spef2Q8C9J3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Spef2Q8C9J3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Spef2Q8C9J3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Spef2Q8C9J3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Spef2Q8C9J3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Spef2Q8C9J3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Spef2Q8C9J3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Spef2Q8C9J3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Spef2Q8C9J3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Spef2Q8C9J3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Spef2Q8C9J3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Spef2Q8C9J3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Spef2Q8C9J3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Spef2Q8C9J3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Spef2Q8C9J3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Spef2Q8C9J3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
Spef2Q8C9J3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Spef2Q8C9J3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Spef2Q8C9J3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Spef2Q8C9J3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Spef2Q8C9J3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Spef2Q8C9J3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Spef2Q8C9J3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Spef2Q8C9J3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Spef2Q8C9J3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Spef2Q8C9J3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Spef2Q8C9J3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Spef2Q8C9J3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Spef2Q8C9J3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Spef2Q8C9J3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Spef2Q8C9J3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Spef2Q8C9J3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Spef2Q8C9J3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Spef2Q8C9J3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Spef2Q8C9J3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Spef2Q8C9J3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Spef2Q8C9J3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Spef2Q8C9J3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Spef2Q8C9J3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Spef2Q8C9J3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Spef2Q8C9J3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Spef2Q8C9J3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Spef2Q8C9J3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Spef2Q8C9J3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Spef2Q8C9J3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms