Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Z9

4930504O13Rik, RIKEN cDNA 4930504O13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
4930504O13RikQ8C5Z9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
4930504O13RikQ8C5Z9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
4930504O13RikQ8C5Z9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
4930504O13RikQ8C5Z9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
4930504O13RikQ8C5Z9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
4930504O13RikQ8C5Z9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
4930504O13RikQ8C5Z9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
4930504O13RikQ8C5Z9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
4930504O13RikQ8C5Z9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
4930504O13RikQ8C5Z9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
4930504O13RikQ8C5Z9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
4930504O13RikQ8C5Z9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
4930504O13RikQ8C5Z9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
4930504O13RikQ8C5Z9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
4930504O13RikQ8C5Z9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
4930504O13RikQ8C5Z9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
4930504O13RikQ8C5Z9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
4930504O13RikQ8C5Z9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
4930504O13RikQ8C5Z9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
4930504O13RikQ8C5Z9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
4930504O13RikQ8C5Z9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
4930504O13RikQ8C5Z9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
4930504O13RikQ8C5Z9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
4930504O13RikQ8C5Z9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
4930504O13RikQ8C5Z9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
4930504O13RikQ8C5Z9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
4930504O13RikQ8C5Z9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
4930504O13RikQ8C5Z9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
4930504O13RikQ8C5Z9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
4930504O13RikQ8C5Z9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
4930504O13RikQ8C5Z9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
4930504O13RikQ8C5Z9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
4930504O13RikQ8C5Z9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
4930504O13RikQ8C5Z9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
4930504O13RikQ8C5Z9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
4930504O13RikQ8C5Z9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
4930504O13RikQ8C5Z9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
4930504O13RikQ8C5Z9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
4930504O13RikQ8C5Z9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
4930504O13RikQ8C5Z9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
4930504O13RikQ8C5Z9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
4930504O13RikQ8C5Z9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
4930504O13RikQ8C5Z9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
4930504O13RikQ8C5Z9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
4930504O13RikQ8C5Z9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
4930504O13RikQ8C5Z9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
4930504O13RikQ8C5Z9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
4930504O13RikQ8C5Z9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
4930504O13RikQ8C5Z9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
4930504O13RikQ8C5Z9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
4930504O13RikQ8C5Z9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
4930504O13RikQ8C5Z9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
4930504O13RikQ8C5Z9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
4930504O13RikQ8C5Z9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
4930504O13RikQ8C5Z9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
4930504O13RikQ8C5Z9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
4930504O13RikQ8C5Z9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
4930504O13RikQ8C5Z9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
4930504O13RikQ8C5Z9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
4930504O13RikQ8C5Z9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
4930504O13RikQ8C5Z9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
4930504O13RikQ8C5Z9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
4930504O13RikQ8C5Z9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
4930504O13RikQ8C5Z9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
4930504O13RikQ8C5Z9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
4930504O13RikQ8C5Z9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
4930504O13RikQ8C5Z9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
4930504O13RikQ8C5Z9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
4930504O13RikQ8C5Z9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
4930504O13RikQ8C5Z9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
4930504O13RikQ8C5Z9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
4930504O13RikQ8C5Z9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
4930504O13RikQ8C5Z9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.55■■■□□ 2
4930504O13RikQ8C5Z9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
4930504O13RikQ8C5Z9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
4930504O13RikQ8C5Z9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
4930504O13RikQ8C5Z9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
4930504O13RikQ8C5Z9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
4930504O13RikQ8C5Z9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
4930504O13RikQ8C5Z9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
4930504O13RikQ8C5Z9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
4930504O13RikQ8C5Z9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
4930504O13RikQ8C5Z9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
4930504O13RikQ8C5Z9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms