Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5X1

4931406P16Rik, RIKEN cDNA 4931406P16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931406P16RikQ8C5X1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
4931406P16RikQ8C5X1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
4931406P16RikQ8C5X1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4931406P16RikQ8C5X1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4931406P16RikQ8C5X1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4931406P16RikQ8C5X1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4931406P16RikQ8C5X1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4931406P16RikQ8C5X1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4931406P16RikQ8C5X1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
4931406P16RikQ8C5X1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
4931406P16RikQ8C5X1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
4931406P16RikQ8C5X1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4931406P16RikQ8C5X1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4931406P16RikQ8C5X1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
4931406P16RikQ8C5X1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4931406P16RikQ8C5X1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4931406P16RikQ8C5X1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4931406P16RikQ8C5X1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4931406P16RikQ8C5X1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4931406P16RikQ8C5X1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
4931406P16RikQ8C5X1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
4931406P16RikQ8C5X1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4931406P16RikQ8C5X1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4931406P16RikQ8C5X1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
4931406P16RikQ8C5X1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
4931406P16RikQ8C5X1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
4931406P16RikQ8C5X1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
4931406P16RikQ8C5X1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4931406P16RikQ8C5X1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4931406P16RikQ8C5X1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4931406P16RikQ8C5X1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4931406P16RikQ8C5X1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
4931406P16RikQ8C5X1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
4931406P16RikQ8C5X1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4931406P16RikQ8C5X1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4931406P16RikQ8C5X1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4931406P16RikQ8C5X1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4931406P16RikQ8C5X1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
4931406P16RikQ8C5X1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4931406P16RikQ8C5X1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
4931406P16RikQ8C5X1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4931406P16RikQ8C5X1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4931406P16RikQ8C5X1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4931406P16RikQ8C5X1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
4931406P16RikQ8C5X1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
4931406P16RikQ8C5X1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
4931406P16RikQ8C5X1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
4931406P16RikQ8C5X1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4931406P16RikQ8C5X1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
4931406P16RikQ8C5X1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4931406P16RikQ8C5X1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
4931406P16RikQ8C5X1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4931406P16RikQ8C5X1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
4931406P16RikQ8C5X1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4931406P16RikQ8C5X1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4931406P16RikQ8C5X1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
4931406P16RikQ8C5X1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
4931406P16RikQ8C5X1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
4931406P16RikQ8C5X1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4931406P16RikQ8C5X1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4931406P16RikQ8C5X1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
4931406P16RikQ8C5X1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4931406P16RikQ8C5X1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4931406P16RikQ8C5X1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4931406P16RikQ8C5X1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
4931406P16RikQ8C5X1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
4931406P16RikQ8C5X1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
4931406P16RikQ8C5X1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
4931406P16RikQ8C5X1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4931406P16RikQ8C5X1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4931406P16RikQ8C5X1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
4931406P16RikQ8C5X1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
4931406P16RikQ8C5X1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
4931406P16RikQ8C5X1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4931406P16RikQ8C5X1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4931406P16RikQ8C5X1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4931406P16RikQ8C5X1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4931406P16RikQ8C5X1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4931406P16RikQ8C5X1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
4931406P16RikQ8C5X1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4931406P16RikQ8C5X1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4931406P16RikQ8C5X1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4931406P16RikQ8C5X1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4931406P16RikQ8C5X1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4931406P16RikQ8C5X1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4931406P16RikQ8C5X1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
4931406P16RikQ8C5X1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4931406P16RikQ8C5X1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
4931406P16RikQ8C5X1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4931406P16RikQ8C5X1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4931406P16RikQ8C5X1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4931406P16RikQ8C5X1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
4931406P16RikQ8C5X1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4931406P16RikQ8C5X1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4931406P16RikQ8C5X1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4931406P16RikQ8C5X1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
4931406P16RikQ8C5X1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
4931406P16RikQ8C5X1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4931406P16RikQ8C5X1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4931406P16RikQ8C5X1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms