Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc90bQ8C3X2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc90bQ8C3X2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc90bQ8C3X2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc90bQ8C3X2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc90bQ8C3X2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc90bQ8C3X2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc90bQ8C3X2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc90bQ8C3X2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc90bQ8C3X2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc90bQ8C3X2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc90bQ8C3X2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc90bQ8C3X2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc90bQ8C3X2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc90bQ8C3X2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc90bQ8C3X2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc90bQ8C3X2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc90bQ8C3X2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc90bQ8C3X2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc90bQ8C3X2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc90bQ8C3X2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc90bQ8C3X2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc90bQ8C3X2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc90bQ8C3X2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc90bQ8C3X2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc90bQ8C3X2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc90bQ8C3X2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc90bQ8C3X2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc90bQ8C3X2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc90bQ8C3X2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc90bQ8C3X2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc90bQ8C3X2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc90bQ8C3X2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc90bQ8C3X2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc90bQ8C3X2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc90bQ8C3X2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc90bQ8C3X2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc90bQ8C3X2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc90bQ8C3X2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc90bQ8C3X2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc90bQ8C3X2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc90bQ8C3X2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc90bQ8C3X2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc90bQ8C3X2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc90bQ8C3X2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc90bQ8C3X2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc90bQ8C3X2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc90bQ8C3X2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc90bQ8C3X2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc90bQ8C3X2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc90bQ8C3X2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc90bQ8C3X2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc90bQ8C3X2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc90bQ8C3X2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc90bQ8C3X2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc90bQ8C3X2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc90bQ8C3X2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc90bQ8C3X2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc90bQ8C3X2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc90bQ8C3X2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc90bQ8C3X2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc90bQ8C3X2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc90bQ8C3X2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc90bQ8C3X2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc90bQ8C3X2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc90bQ8C3X2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc90bQ8C3X2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc90bQ8C3X2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc90bQ8C3X2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc90bQ8C3X2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc90bQ8C3X2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc90bQ8C3X2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc90bQ8C3X2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc90bQ8C3X2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc90bQ8C3X2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc90bQ8C3X2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc90bQ8C3X2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc90bQ8C3X2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc90bQ8C3X2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc90bQ8C3X2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc90bQ8C3X2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc90bQ8C3X2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc90bQ8C3X2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc90bQ8C3X2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc90bQ8C3X2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc90bQ8C3X2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc90bQ8C3X2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc90bQ8C3X2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc90bQ8C3X2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc90bQ8C3X2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc90bQ8C3X2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc90bQ8C3X2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc90bQ8C3X2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc90bQ8C3X2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc90bQ8C3X2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms