Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim35Q8C006 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim35Q8C006 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim35Q8C006 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim35Q8C006 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim35Q8C006 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trim35Q8C006 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim35Q8C006 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim35Q8C006 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim35Q8C006 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim35Q8C006 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim35Q8C006 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim35Q8C006 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim35Q8C006 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim35Q8C006 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim35Q8C006 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim35Q8C006 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim35Q8C006 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim35Q8C006 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim35Q8C006 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim35Q8C006 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim35Q8C006 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim35Q8C006 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim35Q8C006 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim35Q8C006 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim35Q8C006 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim35Q8C006 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim35Q8C006 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim35Q8C006 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim35Q8C006 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim35Q8C006 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim35Q8C006 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim35Q8C006 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim35Q8C006 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim35Q8C006 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim35Q8C006 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim35Q8C006 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim35Q8C006 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim35Q8C006 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim35Q8C006 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim35Q8C006 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim35Q8C006 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim35Q8C006 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim35Q8C006 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim35Q8C006 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim35Q8C006 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim35Q8C006 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim35Q8C006 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim35Q8C006 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim35Q8C006 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim35Q8C006 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim35Q8C006 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim35Q8C006 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim35Q8C006 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim35Q8C006 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim35Q8C006 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim35Q8C006 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim35Q8C006 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim35Q8C006 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim35Q8C006 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim35Q8C006 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim35Q8C006 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim35Q8C006 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim35Q8C006 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim35Q8C006 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim35Q8C006 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim35Q8C006 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim35Q8C006 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim35Q8C006 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim35Q8C006 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim35Q8C006 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim35Q8C006 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim35Q8C006 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim35Q8C006 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim35Q8C006 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim35Q8C006 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim35Q8C006 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim35Q8C006 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim35Q8C006 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim35Q8C006 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim35Q8C006 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim35Q8C006 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim35Q8C006 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim35Q8C006 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim35Q8C006 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim35Q8C006 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim35Q8C006 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim35Q8C006 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim35Q8C006 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim35Q8C006 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim35Q8C006 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim35Q8C006 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim35Q8C006 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim35Q8C006 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim35Q8C006 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim35Q8C006 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim35Q8C006 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim35Q8C006 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Trim35Q8C006 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim35Q8C006 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
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