Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Kdm4aQ8BW72 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Kdm4aQ8BW72 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Kdm4aQ8BW72 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Kdm4aQ8BW72 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Kdm4aQ8BW72 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Kdm4aQ8BW72 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Kdm4aQ8BW72 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Kdm4aQ8BW72 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Kdm4aQ8BW72 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Kdm4aQ8BW72 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kdm4aQ8BW72 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kdm4aQ8BW72 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kdm4aQ8BW72 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kdm4aQ8BW72 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kdm4aQ8BW72 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kdm4aQ8BW72 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kdm4aQ8BW72 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kdm4aQ8BW72 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kdm4aQ8BW72 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kdm4aQ8BW72 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kdm4aQ8BW72 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kdm4aQ8BW72 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kdm4aQ8BW72 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kdm4aQ8BW72 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kdm4aQ8BW72 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kdm4aQ8BW72 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kdm4aQ8BW72 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kdm4aQ8BW72 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Kdm4aQ8BW72 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Kdm4aQ8BW72 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Kdm4aQ8BW72 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Kdm4aQ8BW72 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Kdm4aQ8BW72 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Kdm4aQ8BW72 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Kdm4aQ8BW72 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kdm4aQ8BW72 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kdm4aQ8BW72 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kdm4aQ8BW72 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Kdm4aQ8BW72 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kdm4aQ8BW72 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kdm4aQ8BW72 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kdm4aQ8BW72 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kdm4aQ8BW72 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Kdm4aQ8BW72 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kdm4aQ8BW72 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kdm4aQ8BW72 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kdm4aQ8BW72 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kdm4aQ8BW72 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kdm4aQ8BW72 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kdm4aQ8BW72 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kdm4aQ8BW72 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kdm4aQ8BW72 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kdm4aQ8BW72 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kdm4aQ8BW72 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm4aQ8BW72 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm4aQ8BW72 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Kdm4aQ8BW72 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kdm4aQ8BW72 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kdm4aQ8BW72 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kdm4aQ8BW72 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kdm4aQ8BW72 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm4aQ8BW72 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm4aQ8BW72 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm4aQ8BW72 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm4aQ8BW72 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm4aQ8BW72 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm4aQ8BW72 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kdm4aQ8BW72 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kdm4aQ8BW72 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kdm4aQ8BW72 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kdm4aQ8BW72 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm4aQ8BW72 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm4aQ8BW72 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm4aQ8BW72 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm4aQ8BW72 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm4aQ8BW72 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm4aQ8BW72 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm4aQ8BW72 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdm4aQ8BW72 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kdm4aQ8BW72 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kdm4aQ8BW72 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kdm4aQ8BW72 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kdm4aQ8BW72 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm4aQ8BW72 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm4aQ8BW72 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm4aQ8BW72 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm4aQ8BW72 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm4aQ8BW72 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kdm4aQ8BW72 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kdm4aQ8BW72 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kdm4aQ8BW72 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kdm4aQ8BW72 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kdm4aQ8BW72 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kdm4aQ8BW72 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Kdm4aQ8BW72 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kdm4aQ8BW72 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kdm4aQ8BW72 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kdm4aQ8BW72 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kdm4aQ8BW72 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms