Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW49

Ttc12, Tetratricopeptide repeat protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc12Q8BW49 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ttc12Q8BW49 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ttc12Q8BW49 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ttc12Q8BW49 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ttc12Q8BW49 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ttc12Q8BW49 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ttc12Q8BW49 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ttc12Q8BW49 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ttc12Q8BW49 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ttc12Q8BW49 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ttc12Q8BW49 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ttc12Q8BW49 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ttc12Q8BW49 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ttc12Q8BW49 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ttc12Q8BW49 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ttc12Q8BW49 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ttc12Q8BW49 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ttc12Q8BW49 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ttc12Q8BW49 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ttc12Q8BW49 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ttc12Q8BW49 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ttc12Q8BW49 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ttc12Q8BW49 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ttc12Q8BW49 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ttc12Q8BW49 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ttc12Q8BW49 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ttc12Q8BW49 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ttc12Q8BW49 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ttc12Q8BW49 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ttc12Q8BW49 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ttc12Q8BW49 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ttc12Q8BW49 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ttc12Q8BW49 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ttc12Q8BW49 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ttc12Q8BW49 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ttc12Q8BW49 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ttc12Q8BW49 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ttc12Q8BW49 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ttc12Q8BW49 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ttc12Q8BW49 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ttc12Q8BW49 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ttc12Q8BW49 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ttc12Q8BW49 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ttc12Q8BW49 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ttc12Q8BW49 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ttc12Q8BW49 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ttc12Q8BW49 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ttc12Q8BW49 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ttc12Q8BW49 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ttc12Q8BW49 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ttc12Q8BW49 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ttc12Q8BW49 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ttc12Q8BW49 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ttc12Q8BW49 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ttc12Q8BW49 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ttc12Q8BW49 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ttc12Q8BW49 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ttc12Q8BW49 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ttc12Q8BW49 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ttc12Q8BW49 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ttc12Q8BW49 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ttc12Q8BW49 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ttc12Q8BW49 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ttc12Q8BW49 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ttc12Q8BW49 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ttc12Q8BW49 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Ttc12Q8BW49 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ttc12Q8BW49 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ttc12Q8BW49 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ttc12Q8BW49 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ttc12Q8BW49 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ttc12Q8BW49 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ttc12Q8BW49 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ttc12Q8BW49 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ttc12Q8BW49 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ttc12Q8BW49 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ttc12Q8BW49 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ttc12Q8BW49 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ttc12Q8BW49 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ttc12Q8BW49 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ttc12Q8BW49 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ttc12Q8BW49 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ttc12Q8BW49 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ttc12Q8BW49 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ttc12Q8BW49 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ttc12Q8BW49 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ttc12Q8BW49 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ttc12Q8BW49 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ttc12Q8BW49 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ttc12Q8BW49 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Ttc12Q8BW49 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ttc12Q8BW49 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ttc12Q8BW49 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ttc12Q8BW49 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ttc12Q8BW49 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ttc12Q8BW49 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ttc12Q8BW49 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ttc12Q8BW49 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ttc12Q8BW49 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ttc12Q8BW49 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms