Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUG5

Caps2, Calcyphosin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caps2Q8BUG5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Caps2Q8BUG5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Caps2Q8BUG5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Caps2Q8BUG5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Caps2Q8BUG5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Caps2Q8BUG5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Caps2Q8BUG5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Caps2Q8BUG5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Caps2Q8BUG5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Caps2Q8BUG5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Caps2Q8BUG5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Caps2Q8BUG5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Caps2Q8BUG5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Caps2Q8BUG5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Caps2Q8BUG5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Caps2Q8BUG5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Caps2Q8BUG5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Caps2Q8BUG5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Caps2Q8BUG5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Caps2Q8BUG5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Caps2Q8BUG5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Caps2Q8BUG5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Caps2Q8BUG5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Caps2Q8BUG5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Caps2Q8BUG5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Caps2Q8BUG5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Caps2Q8BUG5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Caps2Q8BUG5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Caps2Q8BUG5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Caps2Q8BUG5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Caps2Q8BUG5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Caps2Q8BUG5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Caps2Q8BUG5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Caps2Q8BUG5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Caps2Q8BUG5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Caps2Q8BUG5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Caps2Q8BUG5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Caps2Q8BUG5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Caps2Q8BUG5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Caps2Q8BUG5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Caps2Q8BUG5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Caps2Q8BUG5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Caps2Q8BUG5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Caps2Q8BUG5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Caps2Q8BUG5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Caps2Q8BUG5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Caps2Q8BUG5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Caps2Q8BUG5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Caps2Q8BUG5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Caps2Q8BUG5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Caps2Q8BUG5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Caps2Q8BUG5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Caps2Q8BUG5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Caps2Q8BUG5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Caps2Q8BUG5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Caps2Q8BUG5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Caps2Q8BUG5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Caps2Q8BUG5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Caps2Q8BUG5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Caps2Q8BUG5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Caps2Q8BUG5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Caps2Q8BUG5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Caps2Q8BUG5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Caps2Q8BUG5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Caps2Q8BUG5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Caps2Q8BUG5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Caps2Q8BUG5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Caps2Q8BUG5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Caps2Q8BUG5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Caps2Q8BUG5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Caps2Q8BUG5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Caps2Q8BUG5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Caps2Q8BUG5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Caps2Q8BUG5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Caps2Q8BUG5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Caps2Q8BUG5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Caps2Q8BUG5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Caps2Q8BUG5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Caps2Q8BUG5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Caps2Q8BUG5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Caps2Q8BUG5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Caps2Q8BUG5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Caps2Q8BUG5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Caps2Q8BUG5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Caps2Q8BUG5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Caps2Q8BUG5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Caps2Q8BUG5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Caps2Q8BUG5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Caps2Q8BUG5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Caps2Q8BUG5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Caps2Q8BUG5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Caps2Q8BUG5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Caps2Q8BUG5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Caps2Q8BUG5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Caps2Q8BUG5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Caps2Q8BUG5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Caps2Q8BUG5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Caps2Q8BUG5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Caps2Q8BUG5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Caps2Q8BUG5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms