Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rd3Q8BRE0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rd3Q8BRE0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rd3Q8BRE0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rd3Q8BRE0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rd3Q8BRE0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rd3Q8BRE0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rd3Q8BRE0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rd3Q8BRE0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rd3Q8BRE0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rd3Q8BRE0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rd3Q8BRE0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rd3Q8BRE0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rd3Q8BRE0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rd3Q8BRE0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rd3Q8BRE0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rd3Q8BRE0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rd3Q8BRE0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rd3Q8BRE0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rd3Q8BRE0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rd3Q8BRE0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rd3Q8BRE0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rd3Q8BRE0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rd3Q8BRE0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rd3Q8BRE0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rd3Q8BRE0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rd3Q8BRE0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rd3Q8BRE0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rd3Q8BRE0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rd3Q8BRE0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rd3Q8BRE0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rd3Q8BRE0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rd3Q8BRE0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rd3Q8BRE0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rd3Q8BRE0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rd3Q8BRE0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rd3Q8BRE0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rd3Q8BRE0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rd3Q8BRE0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rd3Q8BRE0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rd3Q8BRE0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rd3Q8BRE0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rd3Q8BRE0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rd3Q8BRE0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rd3Q8BRE0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rd3Q8BRE0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rd3Q8BRE0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rd3Q8BRE0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rd3Q8BRE0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rd3Q8BRE0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rd3Q8BRE0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rd3Q8BRE0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rd3Q8BRE0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rd3Q8BRE0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rd3Q8BRE0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rd3Q8BRE0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rd3Q8BRE0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rd3Q8BRE0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rd3Q8BRE0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rd3Q8BRE0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rd3Q8BRE0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rd3Q8BRE0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rd3Q8BRE0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rd3Q8BRE0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rd3Q8BRE0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rd3Q8BRE0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rd3Q8BRE0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rd3Q8BRE0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rd3Q8BRE0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rd3Q8BRE0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rd3Q8BRE0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rd3Q8BRE0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rd3Q8BRE0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rd3Q8BRE0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rd3Q8BRE0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rd3Q8BRE0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rd3Q8BRE0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rd3Q8BRE0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rd3Q8BRE0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rd3Q8BRE0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rd3Q8BRE0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rd3Q8BRE0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rd3Q8BRE0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rd3Q8BRE0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rd3Q8BRE0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rd3Q8BRE0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rd3Q8BRE0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rd3Q8BRE0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rd3Q8BRE0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rd3Q8BRE0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rd3Q8BRE0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rd3Q8BRE0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rd3Q8BRE0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rd3Q8BRE0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rd3Q8BRE0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rd3Q8BRE0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Rd3Q8BRE0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Rd3Q8BRE0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rd3Q8BRE0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Rd3Q8BRE0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 225.4 ms