Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLD6

Ankrd55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd55Q8BLD6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd55Q8BLD6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd55Q8BLD6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd55Q8BLD6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd55Q8BLD6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd55Q8BLD6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd55Q8BLD6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd55Q8BLD6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd55Q8BLD6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd55Q8BLD6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd55Q8BLD6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd55Q8BLD6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd55Q8BLD6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd55Q8BLD6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd55Q8BLD6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd55Q8BLD6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ankrd55Q8BLD6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ankrd55Q8BLD6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ankrd55Q8BLD6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ankrd55Q8BLD6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.7 ms