Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp1Q8BJQ2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp1Q8BJQ2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp1Q8BJQ2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp1Q8BJQ2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp1Q8BJQ2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp1Q8BJQ2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp1Q8BJQ2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp1Q8BJQ2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp1Q8BJQ2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp1Q8BJQ2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp1Q8BJQ2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp1Q8BJQ2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp1Q8BJQ2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp1Q8BJQ2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp1Q8BJQ2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp1Q8BJQ2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp1Q8BJQ2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp1Q8BJQ2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp1Q8BJQ2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp1Q8BJQ2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp1Q8BJQ2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp1Q8BJQ2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Usp1Q8BJQ2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp1Q8BJQ2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp1Q8BJQ2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp1Q8BJQ2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp1Q8BJQ2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp1Q8BJQ2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp1Q8BJQ2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp1Q8BJQ2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp1Q8BJQ2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp1Q8BJQ2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp1Q8BJQ2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp1Q8BJQ2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp1Q8BJQ2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp1Q8BJQ2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp1Q8BJQ2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp1Q8BJQ2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp1Q8BJQ2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp1Q8BJQ2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp1Q8BJQ2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp1Q8BJQ2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp1Q8BJQ2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp1Q8BJQ2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp1Q8BJQ2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp1Q8BJQ2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp1Q8BJQ2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp1Q8BJQ2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp1Q8BJQ2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp1Q8BJQ2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp1Q8BJQ2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp1Q8BJQ2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp1Q8BJQ2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp1Q8BJQ2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp1Q8BJQ2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp1Q8BJQ2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp1Q8BJQ2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp1Q8BJQ2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp1Q8BJQ2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp1Q8BJQ2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp1Q8BJQ2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp1Q8BJQ2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp1Q8BJQ2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp1Q8BJQ2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp1Q8BJQ2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp1Q8BJQ2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp1Q8BJQ2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp1Q8BJQ2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp1Q8BJQ2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp1Q8BJQ2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp1Q8BJQ2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp1Q8BJQ2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp1Q8BJQ2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp1Q8BJQ2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp1Q8BJQ2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp1Q8BJQ2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp1Q8BJQ2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp1Q8BJQ2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp1Q8BJQ2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp1Q8BJQ2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp1Q8BJQ2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp1Q8BJQ2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp1Q8BJQ2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp1Q8BJQ2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp1Q8BJQ2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp1Q8BJQ2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp1Q8BJQ2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp1Q8BJQ2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp1Q8BJQ2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp1Q8BJQ2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp1Q8BJQ2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp1Q8BJQ2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp1Q8BJQ2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp1Q8BJQ2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp1Q8BJQ2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp1Q8BJQ2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp1Q8BJQ2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp1Q8BJQ2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp1Q8BJQ2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms